Protein–RNA interactions for Protein: P97368

Meis3, Homeobox protein Meis3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Meis3P97368 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Meis3P97368 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Meis3P97368 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Meis3P97368 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Meis3P97368 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Meis3P97368 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Meis3P97368 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Meis3P97368 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Meis3P97368 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Meis3P97368 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Meis3P97368 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Meis3P97368 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Meis3P97368 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Meis3P97368 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Meis3P97368 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Meis3P97368 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Meis3P97368 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Meis3P97368 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Meis3P97368 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Meis3P97368 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Meis3P97368 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Meis3P97368 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Meis3P97368 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Meis3P97368 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Meis3P97368 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Meis3P97368 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Meis3P97368 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Meis3P97368 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Meis3P97368 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Meis3P97368 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Meis3P97368 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Meis3P97368 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Meis3P97368 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Meis3P97368 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Meis3P97368 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Meis3P97368 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Meis3P97368 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Meis3P97368 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Meis3P97368 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Meis3P97368 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Meis3P97368 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Meis3P97368 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Meis3P97368 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Meis3P97368 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Meis3P97368 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Meis3P97368 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Meis3P97368 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
Meis3P97368 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Meis3P97368 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Meis3P97368 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Meis3P97368 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Meis3P97368 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Meis3P97368 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Meis3P97368 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Meis3P97368 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Meis3P97368 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Meis3P97368 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Meis3P97368 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Meis3P97368 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Meis3P97368 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Meis3P97368 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Meis3P97368 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Meis3P97368 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Meis3P97368 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Meis3P97368 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Meis3P97368 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Meis3P97368 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Meis3P97368 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Meis3P97368 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Meis3P97368 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.33■■□□□ 1.96
Meis3P97368 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Meis3P97368 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Meis3P97368 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Meis3P97368 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Meis3P97368 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis3P97368 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Meis3P97368 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Meis3P97368 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms