Protein–RNA interactions for Protein: P83887

Tubg1, Tubulin gamma-1 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubg1P83887 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubg1P83887 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Tubg1P83887 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tubg1P83887 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tubg1P83887 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubg1P83887 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tubg1P83887 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubg1P83887 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tubg1P83887 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubg1P83887 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubg1P83887 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tubg1P83887 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tubg1P83887 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubg1P83887 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tubg1P83887 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubg1P83887 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubg1P83887 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tubg1P83887 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubg1P83887 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubg1P83887 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubg1P83887 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubg1P83887 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tubg1P83887 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubg1P83887 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tubg1P83887 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tubg1P83887 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tubg1P83887 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tubg1P83887 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tubg1P83887 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tubg1P83887 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubg1P83887 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tubg1P83887 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tubg1P83887 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tubg1P83887 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubg1P83887 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tubg1P83887 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubg1P83887 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tubg1P83887 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tubg1P83887 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tubg1P83887 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tubg1P83887 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms