Protein–RNA interactions for Protein: P80317

Cct6a, T-complex protein 1 subunit zeta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct6aP80317 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cct6aP80317 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cct6aP80317 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Cct6aP80317 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cct6aP80317 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cct6aP80317 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cct6aP80317 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cct6aP80317 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cct6aP80317 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cct6aP80317 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cct6aP80317 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cct6aP80317 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cct6aP80317 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cct6aP80317 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cct6aP80317 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cct6aP80317 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cct6aP80317 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cct6aP80317 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cct6aP80317 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Cct6aP80317 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Cct6aP80317 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Cct6aP80317 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Cct6aP80317 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Cct6aP80317 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Cct6aP80317 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Cct6aP80317 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Cct6aP80317 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Cct6aP80317 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Cct6aP80317 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Cct6aP80317 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cct6aP80317 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Cct6aP80317 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Cct6aP80317 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cct6aP80317 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Cct6aP80317 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Cct6aP80317 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Cct6aP80317 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cct6aP80317 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Cct6aP80317 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Cct6aP80317 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct6aP80317 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Cct6aP80317 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Cct6aP80317 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Cct6aP80317 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Cct6aP80317 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Cct6aP80317 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Cct6aP80317 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cct6aP80317 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Cct6aP80317 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cct6aP80317 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Cct6aP80317 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cct6aP80317 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Cct6aP80317 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Cct6aP80317 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Cct6aP80317 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Cct6aP80317 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cct6aP80317 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Cct6aP80317 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Cct6aP80317 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Cct6aP80317 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cct6aP80317 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cct6aP80317 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cct6aP80317 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cct6aP80317 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cct6aP80317 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cct6aP80317 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cct6aP80317 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cct6aP80317 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cct6aP80317 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct6aP80317 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct6aP80317 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Cct6aP80317 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Cct6aP80317 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Cct6aP80317 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Cct6aP80317 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Cct6aP80317 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Cct6aP80317 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms