Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Traf6P70196 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf6P70196 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Traf6P70196 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf6P70196 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Traf6P70196 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Traf6P70196 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf6P70196 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf6P70196 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Traf6P70196 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Traf6P70196 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf6P70196 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf6P70196 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Traf6P70196 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Traf6P70196 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Traf6P70196 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf6P70196 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf6P70196 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Traf6P70196 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Traf6P70196 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf6P70196 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Traf6P70196 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Traf6P70196 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Traf6P70196 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Traf6P70196 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Traf6P70196 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf6P70196 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf6P70196 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Traf6P70196 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Traf6P70196 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf6P70196 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Traf6P70196 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Traf6P70196 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Traf6P70196 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Traf6P70196 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Traf6P70196 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Traf6P70196 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Traf6P70196 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Traf6P70196 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Traf6P70196 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Traf6P70196 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Traf6P70196 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf6P70196 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Traf6P70196 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Traf6P70196 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Traf6P70196 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Traf6P70196 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Traf6P70196 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Traf6P70196 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Traf6P70196 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Traf6P70196 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Traf6P70196 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf6P70196 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Traf6P70196 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Traf6P70196 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf6P70196 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf6P70196 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Traf6P70196 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf6P70196 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Traf6P70196 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Traf6P70196 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Traf6P70196 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf6P70196 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Traf6P70196 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms