Protein–RNA interactions for Protein: P63321

Rala, Ras-related protein Ral-A, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RalaP63321 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RalaP63321 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RalaP63321 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RalaP63321 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RalaP63321 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RalaP63321 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RalaP63321 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RalaP63321 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RalaP63321 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RalaP63321 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RalaP63321 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RalaP63321 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
RalaP63321 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RalaP63321 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RalaP63321 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RalaP63321 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RalaP63321 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RalaP63321 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RalaP63321 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RalaP63321 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RalaP63321 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RalaP63321 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RalaP63321 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
RalaP63321 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RalaP63321 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RalaP63321 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RalaP63321 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RalaP63321 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RalaP63321 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RalaP63321 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RalaP63321 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RalaP63321 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RalaP63321 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RalaP63321 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RalaP63321 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RalaP63321 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RalaP63321 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
RalaP63321 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
RalaP63321 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
RalaP63321 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
RalaP63321 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
RalaP63321 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RalaP63321 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
RalaP63321 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
RalaP63321 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
RalaP63321 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
RalaP63321 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RalaP63321 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RalaP63321 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
RalaP63321 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RalaP63321 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RalaP63321 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RalaP63321 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RalaP63321 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RalaP63321 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RalaP63321 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
RalaP63321 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RalaP63321 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RalaP63321 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RalaP63321 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RalaP63321 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RalaP63321 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RalaP63321 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RalaP63321 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RalaP63321 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RalaP63321 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RalaP63321 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RalaP63321 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RalaP63321 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RalaP63321 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
RalaP63321 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RalaP63321 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RalaP63321 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
RalaP63321 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RalaP63321 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
RalaP63321 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
RalaP63321 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RalaP63321 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RalaP63321 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RalaP63321 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RalaP63321 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RalaP63321 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RalaP63321 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RalaP63321 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RalaP63321 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RalaP63321 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
RalaP63321 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RalaP63321 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RalaP63321 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RalaP63321 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RalaP63321 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RalaP63321 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RalaP63321 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RalaP63321 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RalaP63321 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RalaP63321 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RalaP63321 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RalaP63321 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RalaP63321 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RalaP63321 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms