Protein–RNA interactions for Protein: P63040

Cplx1, Complexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx1P63040 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30,16■■■□□ 2,42
Cplx1P63040 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Cplx1P63040 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,42
Cplx1P63040 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,14■■■□□ 2,42
Cplx1P63040 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Cplx1P63040 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,12■■■□□ 2,41
Cplx1P63040 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cplx1P63040 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,1■■■□□ 2,41
Cplx1P63040 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Cplx1P63040 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Cplx1P63040 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC30,06■■■□□ 2,4
Cplx1P63040 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Cplx1P63040 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Cplx1P63040 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Cplx1P63040 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC29,98■■■□□ 2,39
Cplx1P63040 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Cplx1P63040 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,97■■■□□ 2,39
Cplx1P63040 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Cplx1P63040 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Cplx1P63040 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,91■■■□□ 2,38
Cplx1P63040 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Cplx1P63040 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cplx1P63040 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Cplx1P63040 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Cplx1P63040 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Cplx1P63040 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Cplx1P63040 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Cplx1P63040 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,78■■■□□ 2,36
Cplx1P63040 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Cplx1P63040 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29,77■■■□□ 2,36
Cplx1P63040 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Cplx1P63040 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Cplx1P63040 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,74■■■□□ 2,35
Cplx1P63040 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Cplx1P63040 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Cplx1P63040 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29,73■■■□□ 2,35
Cplx1P63040 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cplx1P63040 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Cplx1P63040 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,7■■■□□ 2,34
Cplx1P63040 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cplx1P63040 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Cplx1P63040 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Cplx1P63040 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Cplx1P63040 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cplx1P63040 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Cplx1P63040 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Cplx1P63040 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Cplx1P63040 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Cplx1P63040 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Cplx1P63040 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cplx1P63040 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cplx1P63040 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Cplx1P63040 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,59■■■□□ 2,33
Cplx1P63040 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,58■■■□□ 2,33
Cplx1P63040 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Cplx1P63040 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Cplx1P63040 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,56■■■□□ 2,32
Cplx1P63040 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Cplx1P63040 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Cplx1P63040 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Cplx1P63040 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Cplx1P63040 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,5■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29,49■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Cplx1P63040 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Cplx1P63040 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Cplx1P63040 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,4■■■□□ 2,3
Cplx1P63040 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cplx1P63040 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cplx1P63040 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Cplx1P63040 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,29
Cplx1P63040 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cplx1P63040 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Cplx1P63040 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cplx1P63040 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cplx1P63040 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29,35■■■□□ 2,29
Cplx1P63040 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cplx1P63040 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cplx1P63040 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,33■■■□□ 2,29
Cplx1P63040 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29,3■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,29■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Cplx1P63040 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cplx1P63040 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,25■■■□□ 2,27
Cplx1P63040 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms