Protein–RNA interactions for Protein: P62492

Rab11a, Ras-related protein Rab-11A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11aP62492 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rab11aP62492 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,04■□□□□ 0,96
Rab11aP62492 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rab11aP62492 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Rab11aP62492 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rab11aP62492 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rab11aP62492 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Rab11aP62492 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0,95
Rab11aP62492 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0,95
Rab11aP62492 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rab11aP62492 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Rab11aP62492 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Rab11aP62492 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20,94■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,93■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,91■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20,91■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Rab11aP62492 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,87■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,83■□□□□ 0,93
Rab11aP62492 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,8■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,78■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,78■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,92
Rab11aP62492 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,77■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,76■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,75■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,74■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,73■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,71■□□□□ 0,91
Rab11aP62492 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20,69■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,67■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,65■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20,65■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,9
Rab11aP62492 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,6■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,58■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,58■□□□□ 0,89
Rab11aP62492 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,57■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Rab11aP62492 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Rab11aP62492 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Rab11aP62492 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms