Protein–RNA interactions for Protein: P58774

Tpm2, Tropomyosin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm2P58774 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tpm2P58774 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Tpm2P58774 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tpm2P58774 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tpm2P58774 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tpm2P58774 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tpm2P58774 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tpm2P58774 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tpm2P58774 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tpm2P58774 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tpm2P58774 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Tpm2P58774 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tpm2P58774 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tpm2P58774 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tpm2P58774 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tpm2P58774 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tpm2P58774 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Tpm2P58774 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tpm2P58774 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Tpm2P58774 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Tpm2P58774 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Tpm2P58774 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tpm2P58774 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Tpm2P58774 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Tpm2P58774 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Tpm2P58774 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Tpm2P58774 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Tpm2P58774 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Tpm2P58774 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tpm2P58774 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Tpm2P58774 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Tpm2P58774 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tpm2P58774 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Tpm2P58774 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tpm2P58774 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Tpm2P58774 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tpm2P58774 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Tpm2P58774 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tpm2P58774 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tpm2P58774 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Tpm2P58774 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tpm2P58774 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Tpm2P58774 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Tpm2P58774 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Tpm2P58774 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Tpm2P58774 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tpm2P58774 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Tpm2P58774 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Tpm2P58774 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Tpm2P58774 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Tpm2P58774 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Tpm2P58774 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tpm2P58774 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Tpm2P58774 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Tpm2P58774 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Tpm2P58774 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Tpm2P58774 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Tpm2P58774 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Tpm2P58774 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Tpm2P58774 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tpm2P58774 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Tpm2P58774 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Tpm2P58774 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms