Protein–RNA interactions for Protein: P53978

HEF3, Elongation factor 3B, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HEF3P53978 STB1YNL309W 1263 nt13.75□□□□□ -0.21
HEF3P53978 TAD3YLR316C 969 nt13.74□□□□□ -0.21
HEF3P53978 SNG1YGR197C 1644 nt13.73□□□□□ -0.21
HEF3P53978 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt13.73□□□□□ -0.21
HEF3P53978 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.73□□□□□ -0.21
HEF3P53978 AQY1YPR192W 918 nt13.73□□□□□ -0.21
HEF3P53978 YFL067WYFL067W 528 nt13.72□□□□□ -0.21
HEF3P53978 HEM12YDR047W 1089 nt13.7□□□□□ -0.22
HEF3P53978 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt13.68□□□□□ -0.22
HEF3P53978 SPC25YER018C 666 nt13.68□□□□□ -0.22
HEF3P53978 VPS60YDR486C 690 nt13.66□□□□□ -0.22
HEF3P53978 YFL054CYFL054C 1941 nt13.66□□□□□ -0.22
HEF3P53978 CCT4YDL143W 1587 nt13.65□□□□□ -0.22
HEF3P53978 ALG3YBL082C 1377 nt13.63□□□□□ -0.23
HEF3P53978 YDR094WYDR094W 336 nt13.63□□□□□ -0.23
HEF3P53978 ANP1YEL036C 1503 nt13.63□□□□□ -0.23
HEF3P53978 FEN2YCR028C 1539 nt13.61□□□□□ -0.23
HEF3P53978 BDH1YAL060W 1149 nt13.61□□□□□ -0.23
HEF3P53978 PRE6YOL038W 765 nt13.61□□□□□ -0.23
HEF3P53978 GPI16YHR188C 1833 nt13.61□□□□□ -0.23
HEF3P53978 SWC5YBR231C 912 nt13.58□□□□□ -0.24
HEF3P53978 YFL066CYFL066C 1179 nt13.55□□□□□ -0.24
HEF3P53978 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt13.55□□□□□ -0.24
HEF3P53978 YSP3YOR003W 1437 nt13.51□□□□□ -0.25
HEF3P53978 YIR016WYIR016W 798 nt13.49□□□□□ -0.25
HEF3P53978 YLR415CYLR415C 339 nt13.49□□□□□ -0.25
HEF3P53978 YFR018CYFR018C 1092 nt13.48□□□□□ -0.25
HEF3P53978 SPT8YLR055C 1809 nt13.48□□□□□ -0.25
HEF3P53978 YNL115CYNL115C 1935 nt13.46□□□□□ -0.25
HEF3P53978 PAU16YKL224C 372 nt13.44□□□□□ -0.26
HEF3P53978 PEX25YPL112C 1185 nt13.44□□□□□ -0.26
HEF3P53978 RAX1YOR301W 1308 nt13.41□□□□□ -0.26
HEF3P53978 BNA2YJR078W 1362 nt13.39□□□□□ -0.27
HEF3P53978 SWE1YJL187C 2460 nt13.35□□□□□ -0.27
HEF3P53978 MIC12YBR262C 321 nt13.35□□□□□ -0.27
HEF3P53978 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.32□□□□□ -0.28
HEF3P53978 RRT5YFR032C 870 nt13.32□□□□□ -0.28
HEF3P53978 CCA1YER168C 1641 nt13.31□□□□□ -0.28
HEF3P53978 XDJ1YLR090W 1380 nt13.29□□□□□ -0.28
HEF3P53978 SHM2YLR058C 1410 nt13.26□□□□□ -0.29
HEF3P53978 HHO1YPL127C 777 nt13.26□□□□□ -0.29
HEF3P53978 AGP1YCL025C 1902 nt13.25□□□□□ -0.29
HEF3P53978 DUT1YBR252W 444 nt13.21□□□□□ -0.29
HEF3P53978 TIM17YJL143W 477 nt13.2□□□□□ -0.3
HEF3P53978 GDH3YAL062W 1374 nt13.2□□□□□ -0.3
HEF3P53978 PAC11YDR488C 1602 nt13.18□□□□□ -0.3
HEF3P53978 VPS75YNL246W 795 nt13.17□□□□□ -0.3
HEF3P53978 NIT1YIL164C 600 nt13.14□□□□□ -0.31
HEF3P53978 SGT2YOR007C 1041 nt13.13□□□□□ -0.31
HEF3P53978 AVT6YER119C 1347 nt13.13□□□□□ -0.31
HEF3P53978 YGR201CYGR201C 678 nt13.12□□□□□ -0.31
HEF3P53978 MIR1YJR077C 936 nt13.11□□□□□ -0.31
HEF3P53978 PAU7YAR020C 168 nt13.04□□□□□ -0.32
HEF3P53978 GLK1YCL040W 1503 nt13.03□□□□□ -0.32
HEF3P53978 DUS1YML080W 1272 nt13.03□□□□□ -0.32
HEF3P53978 NAT4YMR069W 858 nt13.02□□□□□ -0.33
HEF3P53978 THI74YDR438W 1113 nt13.01□□□□□ -0.33
HEF3P53978 GOR1YNL274C 1053 nt13.01□□□□□ -0.33
HEF3P53978 SHB17YKR043C 816 nt12.99□□□□□ -0.33
HEF3P53978 MSF1YPR047W 1410 nt12.96□□□□□ -0.34
HEF3P53978 YDR010CYDR010C 333 nt12.95□□□□□ -0.34
HEF3P53978 DAT1YML113W 747 nt12.94□□□□□ -0.34
HEF3P53978 FUR4YBR021W 1902 nt12.93□□□□□ -0.34
HEF3P53978 RDN18-1RDN18-1 1800 nt12.92□□□□□ -0.34
HEF3P53978 RDN18-2RDN18-2 1800 nt12.92□□□□□ -0.34
HEF3P53978 UBA4YHR111W 1323 nt12.9□□□□□ -0.34
HEF3P53978 SBA1YKL117W 651 nt12.9□□□□□ -0.34
HEF3P53978 AQY2YLL052C 450 nt12.89□□□□□ -0.35
HEF3P53978 STR3YGL184C 1398 nt12.87□□□□□ -0.35
HEF3P53978 YCL074WYCL074W 927 nt12.84□□□□□ -0.35
HEF3P53978 YSR3YKR053C 1215 nt12.83□□□□□ -0.36
HEF3P53978 YCR102CYCR102C 1107 nt12.82□□□□□ -0.36
HEF3P53978 XYL2YLR070C 1071 nt12.81□□□□□ -0.36
HEF3P53978 PHO89YBR296C 1725 nt12.8□□□□□ -0.36
HEF3P53978 YGL034CYGL034C 366 nt12.79□□□□□ -0.36
HEF3P53978 SHH4YLR164W 507 nt12.79□□□□□ -0.36
HEF3P53978 NBP35YGL091C 987 nt12.77□□□□□ -0.37
HEF3P53978 RET2YFR051C 1641 nt12.77□□□□□ -0.37
HEF3P53978 SFA1YDL168W 1161 nt12.75□□□□□ -0.37
HEF3P53978 HSP60YLR259C 1719 nt12.74□□□□□ -0.37
HEF3P53978 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt12.71□□□□□ -0.37
HEF3P53978 RBG1YAL036C 1110 nt12.67□□□□□ -0.38
HEF3P53978 COQ2YNR041C 1119 nt12.67□□□□□ -0.38
HEF3P53978 YKR005CYKR005C 1578 nt12.64□□□□□ -0.39
HEF3P53978 BOR1YNL275W 1731 nt12.6□□□□□ -0.39
HEF3P53978 PRP4YPR178W 1398 nt12.6□□□□□ -0.39
HEF3P53978 TIR3YIL011W 810 nt12.6□□□□□ -0.39
HEF3P53978 TOM6YOR045W 186 nt12.6□□□□□ -0.39
HEF3P53978 NDI1YML120C 1542 nt12.59□□□□□ -0.39
HEF3P53978 PRO1YDR300C 1287 nt12.58□□□□□ -0.4
HEF3P53978 MRP20YDR405W 792 nt12.58□□□□□ -0.4
HEF3P53978 YGR259CYGR259C 441 nt12.58□□□□□ -0.4
HEF3P53978 AIM45YPR004C 1035 nt12.58□□□□□ -0.4
HEF3P53978 YCR087WYCR087W 516 nt12.55□□□□□ -0.4
HEF3P53978 PEX2YJL210W 816 nt12.54□□□□□ -0.4
HEF3P53978 POM34YLR018C 900 nt12.54□□□□□ -0.4
HEF3P53978 PLB1YMR008C 1995 nt12.54□□□□□ -0.4
HEF3P53978 DPS1YLL018C 1674 nt12.53□□□□□ -0.4
HEF3P53978 RTN2YDL204W 1182 nt12.52□□□□□ -0.41
HEF3P53978 ARP6YLR085C 1317 nt12.49□□□□□ -0.41
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