Protein–RNA interactions for Protein: P53811

Pitpnb, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PitpnbP53811 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PitpnbP53811 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PitpnbP53811 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PitpnbP53811 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PitpnbP53811 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PitpnbP53811 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PitpnbP53811 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PitpnbP53811 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PitpnbP53811 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PitpnbP53811 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PitpnbP53811 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PitpnbP53811 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PitpnbP53811 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PitpnbP53811 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PitpnbP53811 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PitpnbP53811 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PitpnbP53811 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PitpnbP53811 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PitpnbP53811 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PitpnbP53811 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PitpnbP53811 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PitpnbP53811 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PitpnbP53811 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PitpnbP53811 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PitpnbP53811 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PitpnbP53811 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PitpnbP53811 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PitpnbP53811 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PitpnbP53811 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PitpnbP53811 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PitpnbP53811 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PitpnbP53811 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PitpnbP53811 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PitpnbP53811 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PitpnbP53811 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PitpnbP53811 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PitpnbP53811 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PitpnbP53811 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PitpnbP53811 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms