Protein–RNA interactions for Protein: P53187

HOP2, Homologous-pairing protein 2, yeastyeast

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HOP2P53187 DDR2YOL052C-A 186 nt11.57□□□□□ -0.56
HOP2P53187 ATF2YGR177C 1608 nt11.57□□□□□ -0.56
HOP2P53187 CRR1YLR213C 1269 nt11.56□□□□□ -0.56
HOP2P53187 AHT1YHR093W 549 nt11.54□□□□□ -0.56
HOP2P53187 WSC2YNL283C 1512 nt11.53□□□□□ -0.56
HOP2P53187 TAD3YLR316C 969 nt11.51□□□□□ -0.57
HOP2P53187 YFL054CYFL054C 1941 nt11.5□□□□□ -0.57
HOP2P53187 HEM12YDR047W 1089 nt11.5□□□□□ -0.57
HOP2P53187 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.5□□□□□ -0.57
HOP2P53187 STB1YNL309W 1263 nt11.5□□□□□ -0.57
HOP2P53187 BOR1YNL275W 1731 nt11.49□□□□□ -0.57
HOP2P53187 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.48□□□□□ -0.57
HOP2P53187 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.48□□□□□ -0.57
HOP2P53187 SPT8YLR055C 1809 nt11.48□□□□□ -0.57
HOP2P53187 SPC25YER018C 666 nt11.47□□□□□ -0.57
HOP2P53187 Q0182Q0182 405 nt11.46□□□□□ -0.57
HOP2P53187 GPI16YHR188C 1833 nt11.45□□□□□ -0.58
HOP2P53187 SNG1YGR197C 1644 nt11.45□□□□□ -0.58
HOP2P53187 UME6YDR207C 2511 nt11.42□□□□□ -0.58
HOP2P53187 MIC10YCL057C-A 294 nt11.42□□□□□ -0.58
HOP2P53187 CCT4YDL143W 1587 nt11.41□□□□□ -0.58
HOP2P53187 ANP1YEL036C 1503 nt11.41□□□□□ -0.58
HOP2P53187 FEN2YCR028C 1539 nt11.4□□□□□ -0.59
HOP2P53187 SWC5YBR231C 912 nt11.38□□□□□ -0.59
HOP2P53187 VPS60YDR486C 690 nt11.37□□□□□ -0.59
HOP2P53187 YDR094WYDR094W 336 nt11.34□□□□□ -0.59
HOP2P53187 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt11.33□□□□□ -0.6
HOP2P53187 YLR415CYLR415C 339 nt11.32□□□□□ -0.6
HOP2P53187 UBX6YJL048C 1191 nt11.31□□□□□ -0.6
HOP2P53187 BNA2YJR078W 1362 nt11.3□□□□□ -0.6
HOP2P53187 BDH1YAL060W 1149 nt11.3□□□□□ -0.6
HOP2P53187 YIR016WYIR016W 798 nt11.29□□□□□ -0.6
HOP2P53187 RAX1YOR301W 1308 nt11.29□□□□□ -0.6
HOP2P53187 ALG3YBL082C 1377 nt11.28□□□□□ -0.6
HOP2P53187 SWE1YJL187C 2460 nt11.26□□□□□ -0.61
HOP2P53187 YFR018CYFR018C 1092 nt11.24□□□□□ -0.61
HOP2P53187 YSP3YOR003W 1437 nt11.23□□□□□ -0.61
HOP2P53187 PEX25YPL112C 1185 nt11.19□□□□□ -0.62
HOP2P53187 YNL115CYNL115C 1935 nt11.18□□□□□ -0.62
HOP2P53187 MIC12YBR262C 321 nt11.18□□□□□ -0.62
HOP2P53187 RRT5YFR032C 870 nt11.17□□□□□ -0.62
HOP2P53187 HSP60YLR259C 1719 nt11.17□□□□□ -0.62
HOP2P53187 YFL066CYFL066C 1179 nt11.15□□□□□ -0.62
HOP2P53187 RPM1RPM1 483 nt11.15□□□□□ -0.62
HOP2P53187 HHO1YPL127C 777 nt11.14□□□□□ -0.63
HOP2P53187 PRE6YOL038W 765 nt11.12□□□□□ -0.63
HOP2P53187 TIM17YJL143W 477 nt11.11□□□□□ -0.63
HOP2P53187 MCH5YOR306C 1566 nt11.11□□□□□ -0.63
HOP2P53187 XDJ1YLR090W 1380 nt11.1□□□□□ -0.63
HOP2P53187 YGR201CYGR201C 678 nt11.09□□□□□ -0.63
HOP2P53187 PAU16YKL224C 372 nt11.08□□□□□ -0.64
HOP2P53187 CCA1YER168C 1641 nt11.08□□□□□ -0.64
HOP2P53187 ALG12YNR030W 1656 nt11.05□□□□□ -0.64
HOP2P53187 VPS75YNL246W 795 nt11.05□□□□□ -0.64
HOP2P53187 GLK1YCL040W 1503 nt11.04□□□□□ -0.64
HOP2P53187 GDH3YAL062W 1374 nt11.04□□□□□ -0.64
HOP2P53187 SHM2YLR058C 1410 nt11.04□□□□□ -0.64
HOP2P53187 AVT6YER119C 1347 nt10.98□□□□□ -0.65
HOP2P53187 GOR1YNL274C 1053 nt10.97□□□□□ -0.65
HOP2P53187 AGP1YCL025C 1902 nt10.96□□□□□ -0.65
HOP2P53187 PAU7YAR020C 168 nt10.96□□□□□ -0.65
HOP2P53187 FUR4YBR021W 1902 nt10.95□□□□□ -0.66
HOP2P53187 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.93□□□□□ -0.66
HOP2P53187 DUS1YML080W 1272 nt10.93□□□□□ -0.66
HOP2P53187 NIT1YIL164C 600 nt10.91□□□□□ -0.66
HOP2P53187 SGT2YOR007C 1041 nt10.91□□□□□ -0.66
HOP2P53187 NAT4YMR069W 858 nt10.9□□□□□ -0.66
HOP2P53187 MIR1YJR077C 936 nt10.87□□□□□ -0.67
HOP2P53187 DUT1YBR252W 444 nt10.86□□□□□ -0.67
HOP2P53187 THI74YDR438W 1113 nt10.84□□□□□ -0.67
HOP2P53187 DAT1YML113W 747 nt10.84□□□□□ -0.67
HOP2P53187 PRP4YPR178W 1398 nt10.83□□□□□ -0.68
HOP2P53187 YCL074WYCL074W 927 nt10.81□□□□□ -0.68
HOP2P53187 YCR102CYCR102C 1107 nt10.8□□□□□ -0.68
HOP2P53187 AAC1YMR056C 930 nt10.8□□□□□ -0.68
HOP2P53187 MSF1YPR047W 1410 nt10.8□□□□□ -0.68
HOP2P53187 SHB17YKR043C 816 nt10.79□□□□□ -0.68
HOP2P53187 DPS1YLL018C 1674 nt10.76□□□□□ -0.69
HOP2P53187 AQY2YLL052C 450 nt10.76□□□□□ -0.69
HOP2P53187 UBA4YHR111W 1323 nt10.76□□□□□ -0.69
HOP2P53187 STR3YGL184C 1398 nt10.76□□□□□ -0.69
HOP2P53187 YDR010CYDR010C 333 nt10.72□□□□□ -0.69
HOP2P53187 RDN18-1RDN18-1 1800 nt10.71□□□□□ -0.69
HOP2P53187 RDN18-2RDN18-2 1800 nt10.71□□□□□ -0.69
HOP2P53187 YSR3YKR053C 1215 nt10.71□□□□□ -0.69
HOP2P53187 NAR1YNL240C 1476 nt10.71□□□□□ -0.69
HOP2P53187 RET2YFR051C 1641 nt10.69□□□□□ -0.7
HOP2P53187 BMT6YLR063W 1098 nt10.68□□□□□ -0.7
HOP2P53187 NBP35YGL091C 987 nt10.67□□□□□ -0.7
HOP2P53187 YKR005CYKR005C 1578 nt10.66□□□□□ -0.7
HOP2P53187 PHO89YBR296C 1725 nt10.66□□□□□ -0.7
HOP2P53187 YGL034CYGL034C 366 nt10.65□□□□□ -0.7
HOP2P53187 YCR087WYCR087W 516 nt10.63□□□□□ -0.71
HOP2P53187 BIO5YNR056C 1686 nt10.62□□□□□ -0.71
HOP2P53187 XYL2YLR070C 1071 nt10.61□□□□□ -0.71
HOP2P53187 SNF1YDR477W 1902 nt10.6□□□□□ -0.71
HOP2P53187 TIR3YIL011W 810 nt10.6□□□□□ -0.71
HOP2P53187 MRP20YDR405W 792 nt10.58□□□□□ -0.72
HOP2P53187 SFA1YDL168W 1161 nt10.57□□□□□ -0.72
HOP2P53187 RTN2YDL204W 1182 nt10.57□□□□□ -0.72
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