Protein–RNA interactions for Protein: P52825

Cpt2, Carnitine O-palmitoyltransferase 2, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpt2P52825 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cpt2P52825 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cpt2P52825 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cpt2P52825 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cpt2P52825 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cpt2P52825 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cpt2P52825 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cpt2P52825 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Cpt2P52825 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cpt2P52825 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Cpt2P52825 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpt2P52825 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cpt2P52825 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cpt2P52825 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Cpt2P52825 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpt2P52825 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpt2P52825 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cpt2P52825 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cpt2P52825 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpt2P52825 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cpt2P52825 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cpt2P52825 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cpt2P52825 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Cpt2P52825 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Cpt2P52825 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cpt2P52825 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cpt2P52825 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpt2P52825 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cpt2P52825 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Cpt2P52825 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpt2P52825 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cpt2P52825 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpt2P52825 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpt2P52825 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpt2P52825 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cpt2P52825 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpt2P52825 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cpt2P52825 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpt2P52825 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cpt2P52825 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cpt2P52825 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpt2P52825 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cpt2P52825 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpt2P52825 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cpt2P52825 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cpt2P52825 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cpt2P52825 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cpt2P52825 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cpt2P52825 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cpt2P52825 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpt2P52825 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cpt2P52825 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpt2P52825 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpt2P52825 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpt2P52825 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms