Protein–RNA interactions for Protein: P51670

Ccl9, C-C motif chemokine 9, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl9P51670 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl9P51670 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccl9P51670 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccl9P51670 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccl9P51670 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccl9P51670 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccl9P51670 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccl9P51670 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccl9P51670 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ccl9P51670 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccl9P51670 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccl9P51670 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccl9P51670 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccl9P51670 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl9P51670 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ccl9P51670 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ccl9P51670 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl9P51670 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl9P51670 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ccl9P51670 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ccl9P51670 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccl9P51670 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ccl9P51670 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccl9P51670 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Ccl9P51670 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ccl9P51670 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl9P51670 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl9P51670 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl9P51670 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ccl9P51670 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ccl9P51670 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ccl9P51670 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ccl9P51670 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ccl9P51670 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccl9P51670 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccl9P51670 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccl9P51670 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccl9P51670 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccl9P51670 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccl9P51670 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccl9P51670 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccl9P51670 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccl9P51670 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccl9P51670 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl9P51670 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccl9P51670 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccl9P51670 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccl9P51670 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl9P51670 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccl9P51670 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccl9P51670 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccl9P51670 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccl9P51670 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ccl9P51670 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ccl9P51670 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms