Protein–RNA interactions for Protein: P51180

Mip, Lens fiber major intrinsic protein, mousemouse

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Length 263 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MipP51180 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
MipP51180 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MipP51180 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
MipP51180 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MipP51180 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
MipP51180 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MipP51180 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MipP51180 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
MipP51180 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
MipP51180 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
MipP51180 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
MipP51180 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
MipP51180 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
MipP51180 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
MipP51180 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
MipP51180 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
MipP51180 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MipP51180 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
MipP51180 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MipP51180 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MipP51180 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
MipP51180 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MipP51180 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MipP51180 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MipP51180 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MipP51180 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MipP51180 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MipP51180 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MipP51180 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
MipP51180 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MipP51180 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MipP51180 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
MipP51180 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MipP51180 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MipP51180 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MipP51180 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MipP51180 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MipP51180 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MipP51180 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MipP51180 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MipP51180 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MipP51180 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MipP51180 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MipP51180 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MipP51180 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MipP51180 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MipP51180 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MipP51180 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MipP51180 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MipP51180 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MipP51180 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MipP51180 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MipP51180 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MipP51180 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MipP51180 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MipP51180 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MipP51180 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MipP51180 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MipP51180 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MipP51180 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MipP51180 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MipP51180 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MipP51180 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MipP51180 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MipP51180 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MipP51180 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MipP51180 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MipP51180 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MipP51180 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MipP51180 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MipP51180 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MipP51180 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MipP51180 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MipP51180 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MipP51180 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MipP51180 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MipP51180 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MipP51180 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MipP51180 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MipP51180 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MipP51180 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MipP51180 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
MipP51180 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MipP51180 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MipP51180 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
MipP51180 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MipP51180 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MipP51180 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MipP51180 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MipP51180 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MipP51180 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MipP51180 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MipP51180 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MipP51180 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MipP51180 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MipP51180 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MipP51180 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
MipP51180 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
MipP51180 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MipP51180 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
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