Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Nkx2-1P50220 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21,37■■□□□ 1,01
Nkx2-1P50220 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Nkx2-1P50220 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21,35■■□□□ 1,01
Nkx2-1P50220 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21,32■■□□□ 1
Nkx2-1P50220 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21,32■■□□□ 1
Nkx2-1P50220 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,31■■□□□ 1
Nkx2-1P50220 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21,3■■□□□ 1
Nkx2-1P50220 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Nkx2-1P50220 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,29■■□□□ 1
Nkx2-1P50220 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,28■■□□□ 1
Nkx2-1P50220 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,27■■□□□ 1
Nkx2-1P50220 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,26■□□□□ 0,99
Nkx2-1P50220 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,25■□□□□ 0,99
Nkx2-1P50220 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,25■□□□□ 0,99
Nkx2-1P50220 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,24■□□□□ 0,99
Nkx2-1P50220 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,23■□□□□ 0,99
Nkx2-1P50220 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,21■□□□□ 0,99
Nkx2-1P50220 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21,2■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,18■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,18■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21,17■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,17■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,16■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21,16■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,15■□□□□ 0,98
Nkx2-1P50220 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,14■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21,13■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21,13■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,12■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,12■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21,11■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21,1■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21,09■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,09■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,08■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21,08■□□□□ 0,97
Nkx2-1P50220 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21,07■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,07■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21,05■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21,04■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,03■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21,03■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,02■□□□□ 0,96
Nkx2-1P50220 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,01■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,99■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,98■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,98■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,97■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,97■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,96■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,96■□□□□ 0,95
Nkx2-1P50220 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,95■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,95■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,94■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,94■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,93■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20,92■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20,92■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,9■□□□□ 0,94
Nkx2-1P50220 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Nkx2-1P50220 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20,89■□□□□ 0,93
Nkx2-1P50220 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,88■□□□□ 0,93
Nkx2-1P50220 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Nkx2-1P50220 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,87■□□□□ 0,93
Nkx2-1P50220 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Nkx2-1P50220 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Nkx2-1P50220 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20,85■□□□□ 0,93
Nkx2-1P50220 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20,84■□□□□ 0,93
Nkx2-1P50220 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20,83■□□□□ 0,92
Nkx2-1P50220 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,82■□□□□ 0,92
Nkx2-1P50220 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,81■□□□□ 0,92
Nkx2-1P50220 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,81■□□□□ 0,92
Nkx2-1P50220 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20,8■□□□□ 0,92
Nkx2-1P50220 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20,79■□□□□ 0,92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,7 ms