Protein–RNA interactions for Protein: P48615

Wnt11, Protein Wnt-11, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wnt11P48615 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Wnt11P48615 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Wnt11P48615 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Wnt11P48615 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Wnt11P48615 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Wnt11P48615 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Wnt11P48615 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Wnt11P48615 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Wnt11P48615 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Wnt11P48615 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Wnt11P48615 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wnt11P48615 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Wnt11P48615 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wnt11P48615 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Wnt11P48615 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Wnt11P48615 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wnt11P48615 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wnt11P48615 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Wnt11P48615 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wnt11P48615 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Wnt11P48615 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Wnt11P48615 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wnt11P48615 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Wnt11P48615 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wnt11P48615 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Wnt11P48615 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wnt11P48615 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wnt11P48615 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Wnt11P48615 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Wnt11P48615 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Wnt11P48615 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Wnt11P48615 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wnt11P48615 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Wnt11P48615 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wnt11P48615 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Wnt11P48615 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Wnt11P48615 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Wnt11P48615 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Wnt11P48615 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Wnt11P48615 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Wnt11P48615 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Wnt11P48615 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Wnt11P48615 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Wnt11P48615 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Wnt11P48615 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Wnt11P48615 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wnt11P48615 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wnt11P48615 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Wnt11P48615 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Wnt11P48615 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wnt11P48615 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Wnt11P48615 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Wnt11P48615 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Wnt11P48615 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Wnt11P48615 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms