Protein–RNA interactions for Protein: P48545

Kcnj5, G protein-activated inward rectifier potassium channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnj5P48545 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kcnj5P48545 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kcnj5P48545 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnj5P48545 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnj5P48545 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Kcnj5P48545 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kcnj5P48545 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kcnj5P48545 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnj5P48545 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kcnj5P48545 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnj5P48545 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnj5P48545 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnj5P48545 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnj5P48545 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnj5P48545 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Kcnj5P48545 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnj5P48545 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kcnj5P48545 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnj5P48545 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnj5P48545 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnj5P48545 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnj5P48545 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kcnj5P48545 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kcnj5P48545 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnj5P48545 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnj5P48545 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnj5P48545 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnj5P48545 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kcnj5P48545 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnj5P48545 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kcnj5P48545 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kcnj5P48545 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnj5P48545 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Kcnj5P48545 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Kcnj5P48545 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnj5P48545 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Kcnj5P48545 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnj5P48545 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnj5P48545 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnj5P48545 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnj5P48545 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnj5P48545 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnj5P48545 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnj5P48545 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnj5P48545 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnj5P48545 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnj5P48545 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnj5P48545 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Kcnj5P48545 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnj5P48545 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnj5P48545 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnj5P48545 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnj5P48545 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnj5P48545 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnj5P48545 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnj5P48545 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnj5P48545 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnj5P48545 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnj5P48545 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnj5P48545 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnj5P48545 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnj5P48545 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnj5P48545 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnj5P48545 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnj5P48545 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnj5P48545 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnj5P48545 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnj5P48545 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kcnj5P48545 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnj5P48545 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnj5P48545 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnj5P48545 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnj5P48545 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnj5P48545 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnj5P48545 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnj5P48545 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnj5P48545 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnj5P48545 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnj5P48545 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms