Protein–RNA interactions for Protein: P46660

Ina, Alpha-internexin, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
InaP46660 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
InaP46660 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
InaP46660 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
InaP46660 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
InaP46660 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
InaP46660 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
InaP46660 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
InaP46660 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
InaP46660 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
InaP46660 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
InaP46660 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
InaP46660 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
InaP46660 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
InaP46660 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
InaP46660 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
InaP46660 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
InaP46660 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
InaP46660 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
InaP46660 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
InaP46660 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
InaP46660 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
InaP46660 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
InaP46660 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
InaP46660 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
InaP46660 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
InaP46660 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
InaP46660 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
InaP46660 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
InaP46660 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
InaP46660 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
InaP46660 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
InaP46660 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
InaP46660 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
InaP46660 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
InaP46660 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
InaP46660 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
InaP46660 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
InaP46660 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
InaP46660 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
InaP46660 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
InaP46660 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
InaP46660 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
InaP46660 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
InaP46660 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
InaP46660 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
InaP46660 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
InaP46660 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
InaP46660 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
InaP46660 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
InaP46660 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
InaP46660 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
InaP46660 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
InaP46660 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
InaP46660 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
InaP46660 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
InaP46660 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
InaP46660 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
InaP46660 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
InaP46660 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
InaP46660 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
InaP46660 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
InaP46660 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
InaP46660 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
InaP46660 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
InaP46660 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
InaP46660 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
InaP46660 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
InaP46660 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
InaP46660 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
InaP46660 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
InaP46660 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
InaP46660 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
InaP46660 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
InaP46660 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
InaP46660 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
InaP46660 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
InaP46660 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
InaP46660 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
InaP46660 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
InaP46660 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
InaP46660 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
InaP46660 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
InaP46660 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
InaP46660 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
InaP46660 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
InaP46660 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
InaP46660 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
InaP46660 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
InaP46660 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
InaP46660 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
InaP46660 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
InaP46660 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
InaP46660 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
InaP46660 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
InaP46660 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
InaP46660 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
InaP46660 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
InaP46660 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
InaP46660 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
InaP46660 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms