Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Nkx1-2P42580 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Nkx1-2P42580 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
Nkx1-2P42580 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Nkx1-2P42580 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Nkx1-2P42580 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Nkx1-2P42580 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nkx1-2P42580 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nkx1-2P42580 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Nkx1-2P42580 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Nkx1-2P42580 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nkx1-2P42580 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nkx1-2P42580 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Nkx1-2P42580 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Nkx1-2P42580 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Nkx1-2P42580 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Nkx1-2P42580 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Nkx1-2P42580 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Nkx1-2P42580 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nkx1-2P42580 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nkx1-2P42580 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nkx1-2P42580 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Nkx1-2P42580 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Nkx1-2P42580 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
Nkx1-2P42580 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nkx1-2P42580 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nkx1-2P42580 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nkx1-2P42580 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nkx1-2P42580 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nkx1-2P42580 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nkx1-2P42580 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nkx1-2P42580 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nkx1-2P42580 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Nkx1-2P42580 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nkx1-2P42580 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Nkx1-2P42580 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Nkx1-2P42580 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
Nkx1-2P42580 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Nkx1-2P42580 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Nkx1-2P42580 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nkx1-2P42580 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nkx1-2P42580 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nkx1-2P42580 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nkx1-2P42580 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nkx1-2P42580 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nkx1-2P42580 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
Nkx1-2P42580 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nkx1-2P42580 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
Nkx1-2P42580 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nkx1-2P42580 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nkx1-2P42580 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nkx1-2P42580 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nkx1-2P42580 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
Nkx1-2P42580 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
Nkx1-2P42580 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nkx1-2P42580 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Nkx1-2P42580 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.66■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nkx1-2P42580 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nkx1-2P42580 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nkx1-2P42580 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nkx1-2P42580 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Nkx1-2P42580 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nkx1-2P42580 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
Nkx1-2P42580 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
Nkx1-2P42580 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
Nkx1-2P42580 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nkx1-2P42580 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nkx1-2P42580 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Nkx1-2P42580 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nkx1-2P42580 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
Nkx1-2P42580 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nkx1-2P42580 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nkx1-2P42580 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Nkx1-2P42580 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.47■■■□□ 2.63
Nkx1-2P42580 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nkx1-2P42580 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nkx1-2P42580 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
Nkx1-2P42580 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nkx1-2P42580 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.45■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms