Protein–RNA interactions for Protein: P40694

Ighmbp2, DNA-binding protein SMUBP-2, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighmbp2P40694 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Ighmbp2P40694 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ighmbp2P40694 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ighmbp2P40694 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ighmbp2P40694 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Ighmbp2P40694 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ighmbp2P40694 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ighmbp2P40694 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ighmbp2P40694 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Ighmbp2P40694 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ighmbp2P40694 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ighmbp2P40694 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ighmbp2P40694 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Ighmbp2P40694 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ighmbp2P40694 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ighmbp2P40694 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ighmbp2P40694 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ighmbp2P40694 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ighmbp2P40694 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ighmbp2P40694 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ighmbp2P40694 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ighmbp2P40694 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ighmbp2P40694 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ighmbp2P40694 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ighmbp2P40694 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ighmbp2P40694 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Ighmbp2P40694 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ighmbp2P40694 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Ighmbp2P40694 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ighmbp2P40694 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ighmbp2P40694 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ighmbp2P40694 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ighmbp2P40694 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ighmbp2P40694 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ighmbp2P40694 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ighmbp2P40694 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ighmbp2P40694 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ighmbp2P40694 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ighmbp2P40694 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ighmbp2P40694 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ighmbp2P40694 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ighmbp2P40694 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ighmbp2P40694 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ighmbp2P40694 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ighmbp2P40694 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Ighmbp2P40694 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ighmbp2P40694 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ighmbp2P40694 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ighmbp2P40694 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ighmbp2P40694 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ighmbp2P40694 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ighmbp2P40694 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ighmbp2P40694 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ighmbp2P40694 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ighmbp2P40694 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ighmbp2P40694 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Ighmbp2P40694 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ighmbp2P40694 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ighmbp2P40694 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ighmbp2P40694 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ighmbp2P40694 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ighmbp2P40694 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ighmbp2P40694 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ighmbp2P40694 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ighmbp2P40694 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ighmbp2P40694 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ighmbp2P40694 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ighmbp2P40694 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Ighmbp2P40694 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ighmbp2P40694 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ighmbp2P40694 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ighmbp2P40694 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ighmbp2P40694 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ighmbp2P40694 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ighmbp2P40694 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ighmbp2P40694 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ighmbp2P40694 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ighmbp2P40694 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ighmbp2P40694 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ighmbp2P40694 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ighmbp2P40694 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ighmbp2P40694 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms