Protein–RNA interactions for Protein: P38351

PAF1, RNA polymerase II-associated protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PAF1P38351 SPC25YER018C 666 nt15.26■□□□□ 0.03
PAF1P38351 YFL067WYFL067W 528 nt15.26■□□□□ 0.03
PAF1P38351 ATF2YGR177C 1608 nt15.25■□□□□ 0.03
PAF1P38351 BDH1YAL060W 1149 nt15.24■□□□□ 0.03
PAF1P38351 CCT4YDL143W 1587 nt15.24■□□□□ 0.03
PAF1P38351 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt15.23■□□□□ 0.03
PAF1P38351 YFL066CYFL066C 1179 nt15.23■□□□□ 0.03
PAF1P38351 PEX25YPL112C 1185 nt15.23■□□□□ 0.03
PAF1P38351 YLR415CYLR415C 339 nt15.22■□□□□ 0.03
PAF1P38351 GPI16YHR188C 1833 nt15.22■□□□□ 0.03
PAF1P38351 YSP3YOR003W 1437 nt15.2■□□□□ 0.02
PAF1P38351 CRR1YLR213C 1269 nt15.19■□□□□ 0.02
PAF1P38351 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt15.17■□□□□ 0.02
PAF1P38351 GUT2YIL155C 1950 nt15.16■□□□□ 0.02
PAF1P38351 SWC5YBR231C 912 nt15.16■□□□□ 0.02
PAF1P38351 YNL115CYNL115C 1935 nt15.15■□□□□ 0.02
PAF1P38351 NCP1YHR042W 2076 nt15.14■□□□□ 0.01
PAF1P38351 VPS60YDR486C 690 nt15.13■□□□□ 0.01
PAF1P38351 BOP3YNL042W 1191 nt15.09■□□□□ 0.01
PAF1P38351 FEN2YCR028C 1539 nt15.08■□□□□ 0.01
PAF1P38351 ANP1YEL036C 1503 nt15.07■□□□□ 0
PAF1P38351 HEM12YDR047W 1089 nt15.07■□□□□ 0
PAF1P38351 ALG3YBL082C 1377 nt15.05■□□□□ -0
PAF1P38351 SNG1YGR197C 1644 nt15.05■□□□□ -0
PAF1P38351 RTF1YGL244W 1677 nt15.03■□□□□ -0
PAF1P38351 NAT4YMR069W 858 nt15.03■□□□□ -0
PAF1P38351 LYS4YDR234W 2082 nt15.02■□□□□ -0
PAF1P38351 SBA1YKL117W 651 nt15.02■□□□□ -0
PAF1P38351 MIC10YCL057C-A 294 nt15□□□□□ -0.01
PAF1P38351 GLK1YCL040W 1503 nt15□□□□□ -0.01
PAF1P38351 VPS75YNL246W 795 nt14.96□□□□□ -0.01
PAF1P38351 YIR016WYIR016W 798 nt14.94□□□□□ -0.02
PAF1P38351 SPT8YLR055C 1809 nt14.94□□□□□ -0.02
PAF1P38351 PIB2YGL023C 1908 nt14.91□□□□□ -0.02
PAF1P38351 MIR1YJR077C 936 nt14.88□□□□□ -0.03
PAF1P38351 MSF1YPR047W 1410 nt14.86□□□□□ -0.03
PAF1P38351 THI74YDR438W 1113 nt14.86□□□□□ -0.03
PAF1P38351 TIM17YJL143W 477 nt14.84□□□□□ -0.03
PAF1P38351 PAU7YAR020C 168 nt14.8□□□□□ -0.04
PAF1P38351 BNA2YJR078W 1362 nt14.79□□□□□ -0.04
PAF1P38351 Q0182Q0182 405 nt14.78□□□□□ -0.04
PAF1P38351 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt14.78□□□□□ -0.04
PAF1P38351 PAC11YDR488C 1602 nt14.76□□□□□ -0.05
PAF1P38351 PTK1YKL198C 1989 nt14.75□□□□□ -0.05
PAF1P38351 SHM2YLR058C 1410 nt14.73□□□□□ -0.05
PAF1P38351 XDJ1YLR090W 1380 nt14.72□□□□□ -0.05
PAF1P38351 RAX1YOR301W 1308 nt14.7□□□□□ -0.06
PAF1P38351 DAT1YML113W 747 nt14.69□□□□□ -0.06
PAF1P38351 MIC12YBR262C 321 nt14.69□□□□□ -0.06
PAF1P38351 UBA4YHR111W 1323 nt14.63□□□□□ -0.07
PAF1P38351 GDH3YAL062W 1374 nt14.62□□□□□ -0.07
PAF1P38351 SHB17YKR043C 816 nt14.61□□□□□ -0.07
PAF1P38351 HHO1YPL127C 777 nt14.61□□□□□ -0.07
PAF1P38351 YFL054CYFL054C 1941 nt14.6□□□□□ -0.07
PAF1P38351 SGT2YOR007C 1041 nt14.59□□□□□ -0.07
PAF1P38351 YGL034CYGL034C 366 nt14.58□□□□□ -0.08
PAF1P38351 YGR201CYGR201C 678 nt14.58□□□□□ -0.08
PAF1P38351 NIT1YIL164C 600 nt14.57□□□□□ -0.08
PAF1P38351 YSR3YKR053C 1215 nt14.56□□□□□ -0.08
PAF1P38351 YDR010CYDR010C 333 nt14.51□□□□□ -0.09
PAF1P38351 AVT6YER119C 1347 nt14.48□□□□□ -0.09
PAF1P38351 YMR244WYMR244W 1068 nt14.48□□□□□ -0.09
PAF1P38351 XYL2YLR070C 1071 nt14.46□□□□□ -0.09
PAF1P38351 GLR1YPL091W 1452 nt14.45□□□□□ -0.1
PAF1P38351 RET2YFR051C 1641 nt14.42□□□□□ -0.1
PAF1P38351 PHO89YBR296C 1725 nt14.42□□□□□ -0.1
PAF1P38351 NDI1YML120C 1542 nt14.41□□□□□ -0.1
PAF1P38351 YCR087WYCR087W 516 nt14.41□□□□□ -0.1
PAF1P38351 GOR1YNL274C 1053 nt14.41□□□□□ -0.1
PAF1P38351 RBG1YAL036C 1110 nt14.39□□□□□ -0.11
PAF1P38351 YJL225CYJL225C 5277 nt14.39□□□□□ -0.11
PAF1P38351 CCA1YER168C 1641 nt14.34□□□□□ -0.11
PAF1P38351 NVJ2YPR091C 2313 nt14.33□□□□□ -0.11
PAF1P38351 AIM45YPR004C 1035 nt14.32□□□□□ -0.12
PAF1P38351 YCR102CYCR102C 1107 nt14.31□□□□□ -0.12
PAF1P38351 AGP1YCL025C 1902 nt14.3□□□□□ -0.12
PAF1P38351 DUT1YBR252W 444 nt14.28□□□□□ -0.12
PAF1P38351 MRP20YDR405W 792 nt14.27□□□□□ -0.13
PAF1P38351 SWE1YJL187C 2460 nt14.26□□□□□ -0.13
PAF1P38351 RBG2YGR173W 1107 nt14.23□□□□□ -0.13
PAF1P38351 COQ2YNR041C 1119 nt14.21□□□□□ -0.13
PAF1P38351 SFA1YDL168W 1161 nt14.18□□□□□ -0.14
PAF1P38351 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt14.15□□□□□ -0.14
PAF1P38351 DUS1YML080W 1272 nt14.15□□□□□ -0.14
PAF1P38351 YMR226CYMR226C 804 nt14.13□□□□□ -0.15
PAF1P38351 NBP35YGL091C 987 nt14.1□□□□□ -0.15
PAF1P38351 RPL4BYDR012W 1089 nt14.08□□□□□ -0.16
PAF1P38351 RPL4AYBR031W 1089 nt14.08□□□□□ -0.16
PAF1P38351 TIR3YIL011W 810 nt14.07□□□□□ -0.16
PAF1P38351 CLB6YGR109C 1143 nt14.04□□□□□ -0.16
PAF1P38351 AQY2YLL052C 450 nt14.03□□□□□ -0.16
PAF1P38351 SHH4YLR164W 507 nt14.03□□□□□ -0.16
PAF1P38351 STR3YGL184C 1398 nt14.02□□□□□ -0.17
PAF1P38351 YLR111WYLR111W 333 nt14.02□□□□□ -0.17
PAF1P38351 YCL074WYCL074W 927 nt13.98□□□□□ -0.17
PAF1P38351 SDH5YOL071W 489 nt13.97□□□□□ -0.17
PAF1P38351 TOM6YOR045W 186 nt13.97□□□□□ -0.17
PAF1P38351 RPS14BYJL191W 417 nt13.96□□□□□ -0.17
PAF1P38351 UTH1YKR042W 1098 nt13.96□□□□□ -0.17
PAF1P38351 RDN37-1RDN37-1 5354 nt13.96□□□□□ -0.17
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