Protein–RNA interactions for Protein: P36100

TFA1, Transcription initiation factor IIE subunit alpha, yeastyeast

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Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFA1P36100 PIC2YER053C 903 nt15.21■□□□□ 0.03
TFA1P36100 PZF1YPR186C 1290 nt15.21■□□□□ 0.03
TFA1P36100 NAT5YOR253W 531 nt15.17■□□□□ 0.02
TFA1P36100 ICE2YIL090W 1476 nt15.15■□□□□ 0.02
TFA1P36100 RTS2YOR077W 699 nt15.15■□□□□ 0.02
TFA1P36100 YBL081WYBL081W 1107 nt15.14■□□□□ 0.01
TFA1P36100 YSC84YHR016C 1407 nt15.14■□□□□ 0.01
TFA1P36100 ART5YGR068C 1761 nt15.13■□□□□ 0.01
TFA1P36100 GFD2YCL036W 1701 nt15.11■□□□□ 0.01
TFA1P36100 YSP3YOR003W 1437 nt15.1■□□□□ 0.01
TFA1P36100 URE2YNL229C 1065 nt15.09■□□□□ 0.01
TFA1P36100 YCR099CYCR099C 468 nt15.05■□□□□ -0
TFA1P36100 YEL074WYEL074W 339 nt15.05■□□□□ -0
TFA1P36100 SSN3YPL042C 1668 nt15.05■□□□□ -0
TFA1P36100 MOD5YOR274W 1287 nt15.04■□□□□ -0
TFA1P36100 YCH1YGR203W 447 nt15.03■□□□□ -0
TFA1P36100 SIR2YDL042C 1689 nt15.02□□□□□ -0.01
TFA1P36100 PET9YBL030C 957 nt15.01□□□□□ -0.01
TFA1P36100 YLR281CYLR281C 468 nt14.99□□□□□ -0.01
TFA1P36100 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt14.98□□□□□ -0.01
TFA1P36100 AIM41YOR215C 558 nt14.97□□□□□ -0.01
TFA1P36100 YHP1YDR451C 1062 nt14.95□□□□□ -0.02
TFA1P36100 YHL050CYHL050C 2094 nt14.95□□□□□ -0.02
TFA1P36100 TIR4YOR009W 1464 nt14.94□□□□□ -0.02
TFA1P36100 RRT12YCR045C 1476 nt14.93□□□□□ -0.02
TFA1P36100 YNL195CYNL195C 786 nt14.92□□□□□ -0.02
TFA1P36100 RTF1YGL244W 1677 nt14.92□□□□□ -0.02
TFA1P36100 UBX6YJL048C 1191 nt14.91□□□□□ -0.02
TFA1P36100 WHI5YOR083W 888 nt14.91□□□□□ -0.02
TFA1P36100 GET2YER083C 858 nt14.9□□□□□ -0.02
TFA1P36100 MRS3YJL133W 945 nt14.9□□□□□ -0.02
TFA1P36100 CUE1YMR264W 612 nt14.89□□□□□ -0.03
TFA1P36100 BNA3YJL060W 1335 nt14.88□□□□□ -0.03
TFA1P36100 PIB2YGL023C 1908 nt14.88□□□□□ -0.03
TFA1P36100 YCR049CYCR049C 447 nt14.85□□□□□ -0.03
TFA1P36100 CBK1YNL161W 2271 nt14.85□□□□□ -0.03
TFA1P36100 MLS1YNL117W 1665 nt14.84□□□□□ -0.03
TFA1P36100 YIL100WYIL100W 354 nt14.83□□□□□ -0.04
TFA1P36100 NPL6YMR091C 1308 nt14.83□□□□□ -0.04
TFA1P36100 ALG7YBR243C 1347 nt14.83□□□□□ -0.04
TFA1P36100 OCA1YNL099C 717 nt14.82□□□□□ -0.04
TFA1P36100 COA2YPL189C-A 207 nt14.82□□□□□ -0.04
TFA1P36100 RRP1YDR087C 837 nt14.81□□□□□ -0.04
TFA1P36100 LSM12YHR121W 564 nt14.81□□□□□ -0.04
TFA1P36100 BOP3YNL042W 1191 nt14.81□□□□□ -0.04
TFA1P36100 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt14.8□□□□□ -0.04
TFA1P36100 IMT4tM(CAU)E 72 nt14.8□□□□□ -0.04
TFA1P36100 IMT3tM(CAU)J3 72 nt14.8□□□□□ -0.04
TFA1P36100 IMT1tM(CAU)O1 72 nt14.8□□□□□ -0.04
TFA1P36100 IMT2tM(CAU)P 72 nt14.8□□□□□ -0.04
TFA1P36100 CWC25YNL245C 540 nt14.8□□□□□ -0.04
TFA1P36100 MMS21YEL019C 804 nt14.79□□□□□ -0.04
TFA1P36100 YNL234WYNL234W 1281 nt14.79□□□□□ -0.04
TFA1P36100 MPC1YGL080W 393 nt14.77□□□□□ -0.05
TFA1P36100 YPR150WYPR150W 522 nt14.76□□□□□ -0.05
TFA1P36100 GAT1YFL021W 1533 nt14.76□□□□□ -0.05
TFA1P36100 FTR1YER145C 1215 nt14.74□□□□□ -0.05
TFA1P36100 IMP2'YIL154C 1041 nt14.73□□□□□ -0.05
TFA1P36100 YPL277CYPL277C 1464 nt14.72□□□□□ -0.05
TFA1P36100 YJL152WYJL152W 360 nt14.71□□□□□ -0.05
TFA1P36100 TAF4YMR005W 1167 nt14.7□□□□□ -0.06
TFA1P36100 YPL168WYPL168W 1293 nt14.7□□□□□ -0.06
TFA1P36100 PRE2YPR103W 864 nt14.7□□□□□ -0.06
TFA1P36100 PUS2YGL063W 1113 nt14.69□□□□□ -0.06
TFA1P36100 YMR306C-AYMR306C-A 390 nt14.69□□□□□ -0.06
TFA1P36100 YLR460CYLR460C 1131 nt14.67□□□□□ -0.06
TFA1P36100 HDA1YNL021W 2121 nt14.66□□□□□ -0.06
TFA1P36100 PCL10YGL134W 1302 nt14.66□□□□□ -0.06
TFA1P36100 YLR236CYLR236C 324 nt14.65□□□□□ -0.06
TFA1P36100 YHR145CYHR145C 357 nt14.63□□□□□ -0.07
TFA1P36100 PTK1YKL198C 1989 nt14.62□□□□□ -0.07
TFA1P36100 HHO1YPL127C 777 nt14.62□□□□□ -0.07
TFA1P36100 DSK2YMR276W 1122 nt14.61□□□□□ -0.07
TFA1P36100 MRPL36YBR122C 534 nt14.61□□□□□ -0.07
TFA1P36100 YER147C-AYER147C-A 411 nt14.6□□□□□ -0.07
TFA1P36100 DLD2YDL178W 1593 nt14.58□□□□□ -0.08
TFA1P36100 YMR210WYMR210W 1350 nt14.58□□□□□ -0.08
TFA1P36100 AI3Q0060 1248 nt14.55□□□□□ -0.08
TFA1P36100 IDH1YNL037C 1083 nt14.55□□□□□ -0.08
TFA1P36100 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.55□□□□□ -0.08
TFA1P36100 EHD3YDR036C 1503 nt14.55□□□□□ -0.08
TFA1P36100 MIX17YMR002W 471 nt14.54□□□□□ -0.08
TFA1P36100 NUP57YGR119C 1626 nt14.54□□□□□ -0.08
TFA1P36100 CTR1YPR124W 1221 nt14.52□□□□□ -0.09
TFA1P36100 DSE3YOR264W 1293 nt14.51□□□□□ -0.09
TFA1P36100 SUA5YGL169W 1281 nt14.49□□□□□ -0.09
TFA1P36100 COS6YGR295C 1146 nt14.49□□□□□ -0.09
TFA1P36100 YPR011CYPR011C 981 nt14.49□□□□□ -0.09
TFA1P36100 YFL054CYFL054C 1941 nt14.47□□□□□ -0.09
TFA1P36100 MAK32YCR019W 1092 nt14.47□□□□□ -0.09
TFA1P36100 YNL040WYNL040W 1371 nt14.45□□□□□ -0.1
TFA1P36100 SVF1YDR346C 1446 nt14.44□□□□□ -0.1
TFA1P36100 LYS12YIL094C 1116 nt14.44□□□□□ -0.1
TFA1P36100 AQY1YPR192W 918 nt14.44□□□□□ -0.1
TFA1P36100 MGM101YJR144W 810 nt14.41□□□□□ -0.1
TFA1P36100 ERV46YAL042W 1248 nt14.41□□□□□ -0.1
TFA1P36100 GBP2YCL011C 1284 nt14.41□□□□□ -0.1
TFA1P36100 NCP1YHR042W 2076 nt14.4□□□□□ -0.1
TFA1P36100 BUD31YCR063W 474 nt14.38□□□□□ -0.11
TFA1P36100 RRD1YIL153W 1182 nt14.38□□□□□ -0.11
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