Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Apoc1P34928 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Apoc1P34928 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apoc1P34928 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoc1P34928 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apoc1P34928 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoc1P34928 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoc1P34928 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apoc1P34928 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Apoc1P34928 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Apoc1P34928 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Apoc1P34928 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Apoc1P34928 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoc1P34928 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoc1P34928 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apoc1P34928 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apoc1P34928 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apoc1P34928 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apoc1P34928 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Apoc1P34928 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Apoc1P34928 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Apoc1P34928 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Apoc1P34928 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Apoc1P34928 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc1P34928 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc1P34928 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc1P34928 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Apoc1P34928 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Apoc1P34928 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Apoc1P34928 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Apoc1P34928 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoc1P34928 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Apoc1P34928 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Apoc1P34928 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Apoc1P34928 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoc1P34928 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoc1P34928 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Apoc1P34928 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Apoc1P34928 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Apoc1P34928 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Apoc1P34928 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms