Protein–RNA interactions for Protein: P32043

Hoxc5, Homeobox protein Hox-C5, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc5P32043 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxc5P32043 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Hoxc5P32043 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Hoxc5P32043 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Hoxc5P32043 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Hoxc5P32043 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc5P32043 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Hoxc5P32043 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Hoxc5P32043 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc5P32043 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Hoxc5P32043 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Hoxc5P32043 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Hoxc5P32043 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc5P32043 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Hoxc5P32043 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Hoxc5P32043 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc5P32043 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Hoxc5P32043 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Hoxc5P32043 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Hoxc5P32043 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Hoxc5P32043 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Hoxc5P32043 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc5P32043 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Hoxc5P32043 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc5P32043 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Hoxc5P32043 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc5P32043 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc5P32043 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Hoxc5P32043 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc5P32043 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Hoxc5P32043 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Hoxc5P32043 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms