Protein–RNA interactions for Protein: P31001

Des, Desmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DesP31001 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DesP31001 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DesP31001 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DesP31001 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DesP31001 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
DesP31001 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
DesP31001 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
DesP31001 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
DesP31001 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
DesP31001 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
DesP31001 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
DesP31001 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
DesP31001 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DesP31001 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
DesP31001 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DesP31001 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
DesP31001 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DesP31001 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
DesP31001 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DesP31001 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
DesP31001 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
DesP31001 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
DesP31001 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
DesP31001 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
DesP31001 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DesP31001 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DesP31001 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DesP31001 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DesP31001 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DesP31001 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DesP31001 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
DesP31001 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
DesP31001 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
DesP31001 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
DesP31001 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
DesP31001 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
DesP31001 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
DesP31001 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
DesP31001 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
DesP31001 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
DesP31001 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
DesP31001 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DesP31001 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
DesP31001 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
DesP31001 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
DesP31001 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DesP31001 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DesP31001 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
DesP31001 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DesP31001 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
DesP31001 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
DesP31001 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DesP31001 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DesP31001 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
DesP31001 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
DesP31001 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
DesP31001 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DesP31001 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
DesP31001 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DesP31001 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
DesP31001 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
DesP31001 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DesP31001 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DesP31001 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DesP31001 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
DesP31001 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DesP31001 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
DesP31001 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DesP31001 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
DesP31001 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
DesP31001 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DesP31001 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
DesP31001 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
DesP31001 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
DesP31001 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
DesP31001 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
DesP31001 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
DesP31001 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
DesP31001 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
DesP31001 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
DesP31001 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
DesP31001 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DesP31001 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
DesP31001 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
DesP31001 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DesP31001 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
DesP31001 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
DesP31001 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
DesP31001 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
DesP31001 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DesP31001 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
DesP31001 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DesP31001 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
DesP31001 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
DesP31001 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
DesP31001 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
DesP31001 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
DesP31001 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DesP31001 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
DesP31001 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms