Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msr1P30204 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Msr1P30204 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Msr1P30204 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Msr1P30204 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Msr1P30204 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Msr1P30204 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Msr1P30204 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Msr1P30204 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Msr1P30204 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msr1P30204 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Msr1P30204 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msr1P30204 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Msr1P30204 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Msr1P30204 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Msr1P30204 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Msr1P30204 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Msr1P30204 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msr1P30204 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msr1P30204 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msr1P30204 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Msr1P30204 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Msr1P30204 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Msr1P30204 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msr1P30204 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Msr1P30204 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msr1P30204 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Msr1P30204 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msr1P30204 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msr1P30204 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Msr1P30204 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msr1P30204 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Msr1P30204 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msr1P30204 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Msr1P30204 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Msr1P30204 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msr1P30204 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Msr1P30204 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Msr1P30204 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msr1P30204 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msr1P30204 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Msr1P30204 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Msr1P30204 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Msr1P30204 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Msr1P30204 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Msr1P30204 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Msr1P30204 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msr1P30204 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Msr1P30204 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msr1P30204 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Msr1P30204 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Msr1P30204 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Msr1P30204 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Msr1P30204 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Msr1P30204 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Msr1P30204 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msr1P30204 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msr1P30204 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Msr1P30204 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Msr1P30204 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.1 ms