Protein–RNA interactions for Protein: P28776

Ido1, Indoleamine 2,3-dioxygenase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ido1P28776 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ido1P28776 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ido1P28776 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ido1P28776 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ido1P28776 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ido1P28776 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ido1P28776 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ido1P28776 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ido1P28776 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ido1P28776 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ido1P28776 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ido1P28776 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ido1P28776 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ido1P28776 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ido1P28776 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ido1P28776 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ido1P28776 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ido1P28776 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ido1P28776 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ido1P28776 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ido1P28776 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ido1P28776 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ido1P28776 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ido1P28776 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ido1P28776 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ido1P28776 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ido1P28776 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ido1P28776 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ido1P28776 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ido1P28776 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ido1P28776 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ido1P28776 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ido1P28776 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ido1P28776 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ido1P28776 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ido1P28776 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ido1P28776 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ido1P28776 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ido1P28776 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ido1P28776 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ido1P28776 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ido1P28776 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ido1P28776 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ido1P28776 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ido1P28776 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ido1P28776 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ido1P28776 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ido1P28776 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ido1P28776 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ido1P28776 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ido1P28776 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ido1P28776 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ido1P28776 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ido1P28776 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ido1P28776 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ido1P28776 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ido1P28776 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ido1P28776 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ido1P28776 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ido1P28776 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ido1P28776 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ido1P28776 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ido1P28776 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ido1P28776 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ido1P28776 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ido1P28776 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ido1P28776 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ido1P28776 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ido1P28776 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ido1P28776 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ido1P28776 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ido1P28776 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ido1P28776 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms