Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26,08■■□□□ 1,77
RxraP28700 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
RxraP28700 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26,04■■□□□ 1,76
RxraP28700 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
RxraP28700 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,02■■□□□ 1,76
RxraP28700 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,02■■□□□ 1,76
RxraP28700 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,02■■□□□ 1,76
RxraP28700 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,99■■□□□ 1,75
RxraP28700 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
RxraP28700 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
RxraP28700 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
RxraP28700 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
RxraP28700 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,91■■□□□ 1,74
RxraP28700 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
RxraP28700 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
RxraP28700 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
RxraP28700 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
RxraP28700 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
RxraP28700 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
RxraP28700 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
RxraP28700 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,84■■□□□ 1,73
RxraP28700 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
RxraP28700 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
RxraP28700 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
RxraP28700 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
RxraP28700 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
RxraP28700 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
RxraP28700 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25,76■■□□□ 1,71
RxraP28700 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,74■■□□□ 1,71
RxraP28700 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
RxraP28700 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
RxraP28700 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,71
RxraP28700 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
RxraP28700 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
RxraP28700 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
RxraP28700 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
RxraP28700 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,68■■□□□ 1,7
RxraP28700 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,67■■□□□ 1,7
RxraP28700 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
RxraP28700 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25,66■■□□□ 1,7
RxraP28700 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
RxraP28700 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,7
RxraP28700 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25,64■■□□□ 1,69
RxraP28700 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
RxraP28700 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
RxraP28700 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
RxraP28700 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,62■■□□□ 1,69
RxraP28700 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25,61■■□□□ 1,69
RxraP28700 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
RxraP28700 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
RxraP28700 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
RxraP28700 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
RxraP28700 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
RxraP28700 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,56■■□□□ 1,68
RxraP28700 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
RxraP28700 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,53■■□□□ 1,68
RxraP28700 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
RxraP28700 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
RxraP28700 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25,51■■□□□ 1,68
RxraP28700 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,51■■□□□ 1,67
RxraP28700 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
RxraP28700 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
RxraP28700 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
RxraP28700 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
RxraP28700 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
RxraP28700 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
RxraP28700 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25,47■■□□□ 1,67
RxraP28700 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,46■■□□□ 1,67
RxraP28700 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
RxraP28700 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
RxraP28700 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
RxraP28700 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25,44■■□□□ 1,66
RxraP28700 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
RxraP28700 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
RxraP28700 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,42■■□□□ 1,66
RxraP28700 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
RxraP28700 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
RxraP28700 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
RxraP28700 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
RxraP28700 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
RxraP28700 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
RxraP28700 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,65
RxraP28700 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
RxraP28700 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25,36■■□□□ 1,65
RxraP28700 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
RxraP28700 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
RxraP28700 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25,34■■□□□ 1,65
RxraP28700 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
RxraP28700 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
RxraP28700 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
RxraP28700 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
RxraP28700 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
RxraP28700 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
RxraP28700 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,31■■□□□ 1,64
RxraP28700 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,3■■□□□ 1,64
RxraP28700 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RxraP28700 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
RxraP28700 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,29■■□□□ 1,64
RxraP28700 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
RxraP28700 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,1 ms