Protein–RNA interactions for Protein: P27801

PEP3, Vacuolar membrane protein PEP3, yeastyeast

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PEP3P27801 DDR2YOL052C-A 186 nt12.7□□□□□ -0.38
PEP3P27801 MIC10YCL057C-A 294 nt12.66□□□□□ -0.38
PEP3P27801 TAD3YLR316C 969 nt12.65□□□□□ -0.38
PEP3P27801 STB1YNL309W 1263 nt12.65□□□□□ -0.38
PEP3P27801 SNG1YGR197C 1644 nt12.64□□□□□ -0.39
PEP3P27801 HEM12YDR047W 1089 nt12.64□□□□□ -0.39
PEP3P27801 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt12.64□□□□□ -0.39
PEP3P27801 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt12.63□□□□□ -0.39
PEP3P27801 SPC25YER018C 666 nt12.63□□□□□ -0.39
PEP3P27801 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.63□□□□□ -0.39
PEP3P27801 YFL054CYFL054C 1941 nt12.62□□□□□ -0.39
PEP3P27801 GPI16YHR188C 1833 nt12.58□□□□□ -0.4
PEP3P27801 ANP1YEL036C 1503 nt12.57□□□□□ -0.4
PEP3P27801 CCT4YDL143W 1587 nt12.56□□□□□ -0.4
PEP3P27801 FEN2YCR028C 1539 nt12.54□□□□□ -0.4
PEP3P27801 VPS60YDR486C 690 nt12.54□□□□□ -0.4
PEP3P27801 UBX6YJL048C 1191 nt12.52□□□□□ -0.41
PEP3P27801 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt12.51□□□□□ -0.41
PEP3P27801 SWC5YBR231C 912 nt12.51□□□□□ -0.41
PEP3P27801 ALG3YBL082C 1377 nt12.49□□□□□ -0.41
PEP3P27801 YDR094WYDR094W 336 nt12.48□□□□□ -0.41
PEP3P27801 BDH1YAL060W 1149 nt12.48□□□□□ -0.41
PEP3P27801 SPT8YLR055C 1809 nt12.47□□□□□ -0.41
PEP3P27801 YLR415CYLR415C 339 nt12.43□□□□□ -0.42
PEP3P27801 YIR016WYIR016W 798 nt12.42□□□□□ -0.42
PEP3P27801 RAX1YOR301W 1308 nt12.4□□□□□ -0.42
PEP3P27801 YSP3YOR003W 1437 nt12.4□□□□□ -0.42
PEP3P27801 YFR018CYFR018C 1092 nt12.38□□□□□ -0.43
PEP3P27801 BNA2YJR078W 1362 nt12.38□□□□□ -0.43
PEP3P27801 PRE6YOL038W 765 nt12.35□□□□□ -0.43
PEP3P27801 YFL066CYFL066C 1179 nt12.34□□□□□ -0.43
PEP3P27801 PEX25YPL112C 1185 nt12.34□□□□□ -0.43
PEP3P27801 SWE1YJL187C 2460 nt12.33□□□□□ -0.44
PEP3P27801 MIC12YBR262C 321 nt12.33□□□□□ -0.44
PEP3P27801 YNL115CYNL115C 1935 nt12.33□□□□□ -0.44
PEP3P27801 PAC11YDR488C 1602 nt12.31□□□□□ -0.44
PEP3P27801 CCA1YER168C 1641 nt12.26□□□□□ -0.45
PEP3P27801 PAU16YKL224C 372 nt12.24□□□□□ -0.45
PEP3P27801 HHO1YPL127C 777 nt12.24□□□□□ -0.45
PEP3P27801 RRT5YFR032C 870 nt12.23□□□□□ -0.45
PEP3P27801 XDJ1YLR090W 1380 nt12.22□□□□□ -0.45
PEP3P27801 TIM17YJL143W 477 nt12.19□□□□□ -0.46
PEP3P27801 SHM2YLR058C 1410 nt12.18□□□□□ -0.46
PEP3P27801 YGR201CYGR201C 678 nt12.17□□□□□ -0.46
PEP3P27801 AGP1YCL025C 1902 nt12.16□□□□□ -0.46
PEP3P27801 GDH3YAL062W 1374 nt12.15□□□□□ -0.46
PEP3P27801 VPS75YNL246W 795 nt12.14□□□□□ -0.47
PEP3P27801 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.1□□□□□ -0.47
PEP3P27801 AVT6YER119C 1347 nt12.09□□□□□ -0.47
PEP3P27801 NIT1YIL164C 600 nt12.06□□□□□ -0.48
PEP3P27801 DUT1YBR252W 444 nt12.06□□□□□ -0.48
PEP3P27801 SGT2YOR007C 1041 nt12.05□□□□□ -0.48
PEP3P27801 NVJ2YPR091C 2313 nt12.02□□□□□ -0.49
PEP3P27801 GOR1YNL274C 1053 nt12.02□□□□□ -0.49
PEP3P27801 DUS1YML080W 1272 nt12.01□□□□□ -0.49
PEP3P27801 MIR1YJR077C 936 nt12□□□□□ -0.49
PEP3P27801 PAU7YAR020C 168 nt12□□□□□ -0.49
PEP3P27801 GLK1YCL040W 1503 nt11.97□□□□□ -0.49
PEP3P27801 NAT4YMR069W 858 nt11.95□□□□□ -0.5
PEP3P27801 FUR4YBR021W 1902 nt11.94□□□□□ -0.5
PEP3P27801 THI74YDR438W 1113 nt11.93□□□□□ -0.5
PEP3P27801 DAT1YML113W 747 nt11.93□□□□□ -0.5
PEP3P27801 SHB17YKR043C 816 nt11.9□□□□□ -0.5
PEP3P27801 YCL074WYCL074W 927 nt11.89□□□□□ -0.51
PEP3P27801 MSF1YPR047W 1410 nt11.87□□□□□ -0.51
PEP3P27801 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.87□□□□□ -0.51
PEP3P27801 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.87□□□□□ -0.51
PEP3P27801 STR3YGL184C 1398 nt11.87□□□□□ -0.51
PEP3P27801 YDR010CYDR010C 333 nt11.86□□□□□ -0.51
PEP3P27801 YCR102CYCR102C 1107 nt11.85□□□□□ -0.51
PEP3P27801 AQY2YLL052C 450 nt11.85□□□□□ -0.51
PEP3P27801 UBA4YHR111W 1323 nt11.84□□□□□ -0.51
PEP3P27801 HSP60YLR259C 1719 nt11.8□□□□□ -0.52
PEP3P27801 YSR3YKR053C 1215 nt11.77□□□□□ -0.53
PEP3P27801 NBP35YGL091C 987 nt11.76□□□□□ -0.53
PEP3P27801 RET2YFR051C 1641 nt11.75□□□□□ -0.53
PEP3P27801 PHO89YBR296C 1725 nt11.74□□□□□ -0.53
PEP3P27801 YJL225CYJL225C 5277 nt11.73□□□□□ -0.53
PEP3P27801 BOR1YNL275W 1731 nt11.72□□□□□ -0.53
PEP3P27801 YGL034CYGL034C 366 nt11.71□□□□□ -0.53
PEP3P27801 XYL2YLR070C 1071 nt11.7□□□□□ -0.54
PEP3P27801 SHH4YLR164W 507 nt11.69□□□□□ -0.54
PEP3P27801 YKR005CYKR005C 1578 nt11.69□□□□□ -0.54
PEP3P27801 SFA1YDL168W 1161 nt11.68□□□□□ -0.54
PEP3P27801 PRP4YPR178W 1398 nt11.67□□□□□ -0.54
PEP3P27801 YHL019W-AYHL019W-A 594 nt11.66□□□□□ -0.54
PEP3P27801 SBA1YKL117W 651 nt11.66□□□□□ -0.54
PEP3P27801 TIR3YIL011W 810 nt11.65□□□□□ -0.54
PEP3P27801 YGR259CYGR259C 441 nt11.64□□□□□ -0.55
PEP3P27801 RTN2YDL204W 1182 nt11.62□□□□□ -0.55
PEP3P27801 YCR087WYCR087W 516 nt11.61□□□□□ -0.55
PEP3P27801 DPS1YLL018C 1674 nt11.6□□□□□ -0.55
PEP3P27801 COQ2YNR041C 1119 nt11.6□□□□□ -0.55
PEP3P27801 MRP20YDR405W 792 nt11.58□□□□□ -0.56
PEP3P27801 RBG1YAL036C 1110 nt11.57□□□□□ -0.56
PEP3P27801 BMT6YLR063W 1098 nt11.57□□□□□ -0.56
PEP3P27801 AIM45YPR004C 1035 nt11.57□□□□□ -0.56
PEP3P27801 ARP6YLR085C 1317 nt11.57□□□□□ -0.56
PEP3P27801 PRO1YDR300C 1287 nt11.55□□□□□ -0.56
PEP3P27801 POM34YLR018C 900 nt11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 83.1 ms