Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pou3f1P21952 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pou3f1P21952 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pou3f1P21952 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pou3f1P21952 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou3f1P21952 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Pou3f1P21952 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou3f1P21952 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou3f1P21952 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou3f1P21952 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou3f1P21952 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pou3f1P21952 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pou3f1P21952 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pou3f1P21952 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pou3f1P21952 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pou3f1P21952 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pou3f1P21952 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pou3f1P21952 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou3f1P21952 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pou3f1P21952 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou3f1P21952 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pou3f1P21952 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f1P21952 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f1P21952 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pou3f1P21952 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pou3f1P21952 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pou3f1P21952 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou3f1P21952 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pou3f1P21952 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pou3f1P21952 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f1P21952 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f1P21952 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pou3f1P21952 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f1P21952 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pou3f1P21952 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pou3f1P21952 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pou3f1P21952 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou3f1P21952 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pou3f1P21952 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pou3f1P21952 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou3f1P21952 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou3f1P21952 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou3f1P21952 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pou3f1P21952 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou3f1P21952 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou3f1P21952 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pou3f1P21952 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pou3f1P21952 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou3f1P21952 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Pou3f1P21952 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou3f1P21952 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Pou3f1P21952 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pou3f1P21952 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pou3f1P21952 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pou3f1P21952 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou3f1P21952 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou3f1P21952 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pou3f1P21952 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Pou3f1P21952 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou3f1P21952 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Pou3f1P21952 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pou3f1P21952 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou3f1P21952 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pou3f1P21952 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pou3f1P21952 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou3f1P21952 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou3f1P21952 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pou3f1P21952 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pou3f1P21952 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou3f1P21952 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pou3f1P21952 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pou3f1P21952 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou3f1P21952 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pou3f1P21952 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pou3f1P21952 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pou3f1P21952 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pou3f1P21952 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou3f1P21952 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pou3f1P21952 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Pou3f1P21952 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pou3f1P21952 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pou3f1P21952 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pou3f1P21952 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pou3f1P21952 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms