Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BdnfP21237 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BdnfP21237 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BdnfP21237 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BdnfP21237 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BdnfP21237 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BdnfP21237 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BdnfP21237 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BdnfP21237 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BdnfP21237 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BdnfP21237 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BdnfP21237 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BdnfP21237 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BdnfP21237 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BdnfP21237 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BdnfP21237 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BdnfP21237 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BdnfP21237 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BdnfP21237 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BdnfP21237 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BdnfP21237 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BdnfP21237 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BdnfP21237 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
BdnfP21237 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BdnfP21237 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BdnfP21237 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BdnfP21237 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BdnfP21237 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BdnfP21237 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BdnfP21237 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
BdnfP21237 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BdnfP21237 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BdnfP21237 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
BdnfP21237 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
BdnfP21237 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BdnfP21237 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BdnfP21237 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BdnfP21237 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BdnfP21237 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BdnfP21237 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BdnfP21237 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BdnfP21237 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
BdnfP21237 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
BdnfP21237 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
BdnfP21237 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
BdnfP21237 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BdnfP21237 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BdnfP21237 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BdnfP21237 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BdnfP21237 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BdnfP21237 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
BdnfP21237 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BdnfP21237 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
BdnfP21237 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BdnfP21237 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BdnfP21237 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BdnfP21237 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BdnfP21237 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms