Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,93■■□□□ 1,58
BdnfP21237 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
BdnfP21237 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
BdnfP21237 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
BdnfP21237 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
BdnfP21237 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
BdnfP21237 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,87■■□□□ 1,57
BdnfP21237 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
BdnfP21237 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,84■■□□□ 1,57
BdnfP21237 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
BdnfP21237 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
BdnfP21237 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
BdnfP21237 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
BdnfP21237 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,74■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24,73■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,71■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
BdnfP21237 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,69■■□□□ 1,54
BdnfP21237 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
BdnfP21237 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
BdnfP21237 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
BdnfP21237 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,64■■□□□ 1,54
BdnfP21237 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
BdnfP21237 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
BdnfP21237 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
BdnfP21237 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
BdnfP21237 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,53
BdnfP21237 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24,58■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24,57■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24,56■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24,55■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,55■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,54■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
BdnfP21237 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
BdnfP21237 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
BdnfP21237 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
BdnfP21237 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
BdnfP21237 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
BdnfP21237 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
BdnfP21237 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
BdnfP21237 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
BdnfP21237 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24,45■■□□□ 1,51
BdnfP21237 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24,43■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24,42■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24,42■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24,4■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,4■■□□□ 1,5
BdnfP21237 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24,4■■□□□ 1,5
BdnfP21237 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24,39■■□□□ 1,49
BdnfP21237 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,38■■□□□ 1,49
BdnfP21237 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,37■■□□□ 1,49
BdnfP21237 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24,37■■□□□ 1,49
BdnfP21237 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,36■■□□□ 1,49
BdnfP21237 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24,36■■□□□ 1,49
BdnfP21237 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
BdnfP21237 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
BdnfP21237 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,49
BdnfP21237 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24,32■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,32■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24,31■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,31■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24,3■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
BdnfP21237 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
BdnfP21237 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,26■■□□□ 1,47
BdnfP21237 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
BdnfP21237 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
BdnfP21237 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
BdnfP21237 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,23■■□□□ 1,47
BdnfP21237 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24,23■■□□□ 1,47
BdnfP21237 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,22■■□□□ 1,47
BdnfP21237 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
BdnfP21237 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
BdnfP21237 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
BdnfP21237 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22,6 ms