Protein–RNA interactions for Protein: P17679

Gata1, Erythroid transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata1P17679 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gata1P17679 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gata1P17679 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata1P17679 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gata1P17679 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gata1P17679 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata1P17679 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata1P17679 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gata1P17679 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gata1P17679 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gata1P17679 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata1P17679 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata1P17679 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gata1P17679 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gata1P17679 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gata1P17679 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gata1P17679 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gata1P17679 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gata1P17679 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata1P17679 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata1P17679 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gata1P17679 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata1P17679 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gata1P17679 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata1P17679 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Gata1P17679 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gata1P17679 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gata1P17679 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gata1P17679 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Gata1P17679 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gata1P17679 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata1P17679 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gata1P17679 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata1P17679 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gata1P17679 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gata1P17679 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata1P17679 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gata1P17679 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Gata1P17679 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gata1P17679 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms