Protein–RNA interactions for Protein: P15379

Cd44, CD44 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd44P15379 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Cd44P15379 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cd44P15379 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Cd44P15379 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Cd44P15379 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cd44P15379 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Cd44P15379 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd44P15379 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Cd44P15379 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Cd44P15379 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd44P15379 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Cd44P15379 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cd44P15379 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cd44P15379 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cd44P15379 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Cd44P15379 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cd44P15379 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.53■■■□□ 2
Cd44P15379 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd44P15379 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cd44P15379 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Cd44P15379 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd44P15379 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cd44P15379 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cd44P15379 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd44P15379 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Cd44P15379 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd44P15379 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cd44P15379 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd44P15379 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cd44P15379 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cd44P15379 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cd44P15379 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cd44P15379 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cd44P15379 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd44P15379 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cd44P15379 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cd44P15379 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cd44P15379 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cd44P15379 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cd44P15379 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cd44P15379 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd44P15379 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cd44P15379 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd44P15379 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Cd44P15379 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cd44P15379 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Cd44P15379 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd44P15379 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Cd44P15379 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cd44P15379 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cd44P15379 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cd44P15379 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cd44P15379 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cd44P15379 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cd44P15379 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd44P15379 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cd44P15379 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Cd44P15379 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cd44P15379 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cd44P15379 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Cd44P15379 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd44P15379 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd44P15379 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd44P15379 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cd44P15379 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cd44P15379 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cd44P15379 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cd44P15379 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cd44P15379 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cd44P15379 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cd44P15379 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cd44P15379 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cd44P15379 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cd44P15379 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cd44P15379 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cd44P15379 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cd44P15379 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cd44P15379 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cd44P15379 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Cd44P15379 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cd44P15379 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Cd44P15379 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cd44P15379 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cd44P15379 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cd44P15379 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cd44P15379 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Cd44P15379 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Cd44P15379 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms