Protein–RNA interactions for Protein: P10078

Zfp28, Zinc finger protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp28P10078 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp28P10078 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp28P10078 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp28P10078 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Zfp28P10078 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp28P10078 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Zfp28P10078 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp28P10078 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp28P10078 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp28P10078 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp28P10078 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp28P10078 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Zfp28P10078 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp28P10078 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp28P10078 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp28P10078 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp28P10078 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp28P10078 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp28P10078 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp28P10078 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp28P10078 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp28P10078 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp28P10078 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp28P10078 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Zfp28P10078 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Zfp28P10078 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp28P10078 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Zfp28P10078 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Zfp28P10078 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Zfp28P10078 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Zfp28P10078 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Zfp28P10078 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Zfp28P10078 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp28P10078 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Zfp28P10078 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp28P10078 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp28P10078 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp28P10078 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Zfp28P10078 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Zfp28P10078 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Zfp28P10078 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp28P10078 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp28P10078 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Zfp28P10078 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Zfp28P10078 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp28P10078 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Zfp28P10078 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms