Protein–RNA interactions for Protein: P0CX38

RPS6B, 40S ribosomal protein S6-B, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS6BP0CX38 YDL086C-AYDL086C-A 435 nt11.9□□□□□ -0.5
RPS6BP0CX38 YKL030WYKL030W 606 nt11.89□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 RTG1YOL067C 534 nt11.89□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 NVJ2YPR091C 2313 nt11.88□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 ANP1YEL036C 1503 nt11.88□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 WSC2YNL283C 1512 nt11.88□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 AQY1YPR192W 918 nt11.87□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 STB1YNL309W 1263 nt11.86□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 YDR524C-BYDR524C-B 201 nt11.85□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 SPC25YER018C 666 nt11.84□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 RAX1YOR301W 1308 nt11.84□□□□□ -0.51
RPS6BP0CX38 AHT1YHR093W 549 nt11.83□□□□□ -0.52
RPS6BP0CX38 CCA1YER168C 1641 nt11.82□□□□□ -0.52
RPS6BP0CX38 FEN2YCR028C 1539 nt11.81□□□□□ -0.52
RPS6BP0CX38 VPS60YDR486C 690 nt11.77□□□□□ -0.53
RPS6BP0CX38 GPI16YHR188C 1833 nt11.75□□□□□ -0.53
RPS6BP0CX38 PAU21YOR394W 495 nt11.75□□□□□ -0.53
RPS6BP0CX38 PAU22YPL282C 495 nt11.75□□□□□ -0.53
RPS6BP0CX38 ALG3YBL082C 1377 nt11.75□□□□□ -0.53
RPS6BP0CX38 CCT4YDL143W 1587 nt11.75□□□□□ -0.53
RPS6BP0CX38 YPR064WYPR064W 420 nt11.73□□□□□ -0.53
RPS6BP0CX38 MIC12YBR262C 321 nt11.72□□□□□ -0.53
RPS6BP0CX38 YIR016WYIR016W 798 nt11.7□□□□□ -0.54
RPS6BP0CX38 BNA2YJR078W 1362 nt11.69□□□□□ -0.54
RPS6BP0CX38 AGP1YCL025C 1902 nt11.69□□□□□ -0.54
RPS6BP0CX38 TAD3YLR316C 969 nt11.69□□□□□ -0.54
RPS6BP0CX38 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.68□□□□□ -0.54
RPS6BP0CX38 YEL076CYEL076C 651 nt11.68□□□□□ -0.54
RPS6BP0CX38 YLR464WYLR464W 651 nt11.68□□□□□ -0.54
RPS6BP0CX38 BOR1YNL275W 1731 nt11.67□□□□□ -0.54
RPS6BP0CX38 HSP60YLR259C 1719 nt11.66□□□□□ -0.54
RPS6BP0CX38 FUR4YBR021W 1902 nt11.64□□□□□ -0.55
RPS6BP0CX38 SWC5YBR231C 912 nt11.64□□□□□ -0.55
RPS6BP0CX38 ARO7YPR060C 771 nt11.62□□□□□ -0.55
RPS6BP0CX38 BDH1YAL060W 1149 nt11.6□□□□□ -0.55
RPS6BP0CX38 HHO1YPL127C 777 nt11.59□□□□□ -0.55
RPS6BP0CX38 GLK1YCL040W 1503 nt11.58□□□□□ -0.56
RPS6BP0CX38 HUA1YGR268C 597 nt11.57□□□□□ -0.56
RPS6BP0CX38 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.55□□□□□ -0.56
RPS6BP0CX38 MRPL8YJL063C 717 nt11.54□□□□□ -0.56
RPS6BP0CX38 DUT1YBR252W 444 nt11.53□□□□□ -0.56
RPS6BP0CX38 XDJ1YLR090W 1380 nt11.53□□□□□ -0.56
RPS6BP0CX38 YGR201CYGR201C 678 nt11.48□□□□□ -0.57
RPS6BP0CX38 YLR415CYLR415C 339 nt11.48□□□□□ -0.57
RPS6BP0CX38 YSP3YOR003W 1437 nt11.48□□□□□ -0.57
RPS6BP0CX38 ADO1YJR105W 1023 nt11.47□□□□□ -0.57
RPS6BP0CX38 DUS1YML080W 1272 nt11.46□□□□□ -0.57
RPS6BP0CX38 RDN18-1RDN18-1 1800 nt11.42□□□□□ -0.58
RPS6BP0CX38 RDN18-2RDN18-2 1800 nt11.42□□□□□ -0.58
RPS6BP0CX38 SHM2YLR058C 1410 nt11.42□□□□□ -0.58
RPS6BP0CX38 GDH3YAL062W 1374 nt11.41□□□□□ -0.58
RPS6BP0CX38 YCL074WYCL074W 927 nt11.41□□□□□ -0.58
RPS6BP0CX38 PRP4YPR178W 1398 nt11.41□□□□□ -0.58
RPS6BP0CX38 AVT6YER119C 1347 nt11.38□□□□□ -0.59
RPS6BP0CX38 MET8YBR213W 825 nt11.37□□□□□ -0.59
RPS6BP0CX38 STR3YGL184C 1398 nt11.37□□□□□ -0.59
RPS6BP0CX38 DPS1YLL018C 1674 nt11.36□□□□□ -0.59
RPS6BP0CX38 YNL115CYNL115C 1935 nt11.36□□□□□ -0.59
RPS6BP0CX38 YKR005CYKR005C 1578 nt11.36□□□□□ -0.59
RPS6BP0CX38 YFL066CYFL066C 1179 nt11.35□□□□□ -0.59
RPS6BP0CX38 GOR1YNL274C 1053 nt11.33□□□□□ -0.6
RPS6BP0CX38 NIT1YIL164C 600 nt11.32□□□□□ -0.6
RPS6BP0CX38 PEX25YPL112C 1185 nt11.32□□□□□ -0.6
RPS6BP0CX38 TIM17YJL143W 477 nt11.31□□□□□ -0.6
RPS6BP0CX38 ALG12YNR030W 1656 nt11.3□□□□□ -0.6
RPS6BP0CX38 CLB6YGR109C 1143 nt11.27□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 AQY2YLL052C 450 nt11.27□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 SNF1YDR477W 1902 nt11.27□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 YGR259CYGR259C 441 nt11.26□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 PRE6YOL038W 765 nt11.26□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 YFR018CYFR018C 1092 nt11.24□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 AAC1YMR056C 930 nt11.24□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 SGT2YOR007C 1041 nt11.24□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 REG2YBR050C 1017 nt11.23□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 DAT1YML113W 747 nt11.21□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 UME6YDR207C 2511 nt11.21□□□□□ -0.61
RPS6BP0CX38 YJL225CYJL225C 5277 nt11.2□□□□□ -0.62
RPS6BP0CX38 BMT6YLR063W 1098 nt11.2□□□□□ -0.62
RPS6BP0CX38 VPS75YNL246W 795 nt11.17□□□□□ -0.62
RPS6BP0CX38 BIO5YNR056C 1686 nt11.17□□□□□ -0.62
RPS6BP0CX38 NBP35YGL091C 987 nt11.14□□□□□ -0.63
RPS6BP0CX38 YDR094WYDR094W 336 nt11.12□□□□□ -0.63
RPS6BP0CX38 YCR102CYCR102C 1107 nt11.11□□□□□ -0.63
RPS6BP0CX38 IRC24YIR036C 792 nt11.11□□□□□ -0.63
RPS6BP0CX38 PAM17YKR065C 594 nt11.1□□□□□ -0.63
RPS6BP0CX38 RTN2YDL204W 1182 nt11.09□□□□□ -0.63
RPS6BP0CX38 MCH5YOR306C 1566 nt11.08□□□□□ -0.64
RPS6BP0CX38 UBX6YJL048C 1191 nt11.06□□□□□ -0.64
RPS6BP0CX38 PLB1YMR008C 1995 nt11.04□□□□□ -0.64
RPS6BP0CX38 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.03□□□□□ -0.64
RPS6BP0CX38 SHH4YLR164W 507 nt11.03□□□□□ -0.64
RPS6BP0CX38 PAU16YKL224C 372 nt11.02□□□□□ -0.65
RPS6BP0CX38 PBP1YGR178C 2169 nt11.01□□□□□ -0.65
RPS6BP0CX38 YDR010CYDR010C 333 nt11□□□□□ -0.65
RPS6BP0CX38 RRT5YFR032C 870 nt11□□□□□ -0.65
RPS6BP0CX38 ARP6YLR085C 1317 nt11□□□□□ -0.65
RPS6BP0CX38 NAR1YNL240C 1476 nt11□□□□□ -0.65
RPS6BP0CX38 MIR1YJR077C 936 nt10.98□□□□□ -0.65
RPS6BP0CX38 SHB17YKR043C 816 nt10.97□□□□□ -0.65
RPS6BP0CX38 PAU7YAR020C 168 nt10.97□□□□□ -0.65
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