Protein–RNA interactions for Protein: O88958

Gnpda1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnpda1O88958 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Gnpda1O88958 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gnpda1O88958 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gnpda1O88958 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gnpda1O88958 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gnpda1O88958 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gnpda1O88958 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gnpda1O88958 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gnpda1O88958 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gnpda1O88958 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Gnpda1O88958 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gnpda1O88958 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gnpda1O88958 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gnpda1O88958 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gnpda1O88958 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gnpda1O88958 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gnpda1O88958 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Gnpda1O88958 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Gnpda1O88958 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gnpda1O88958 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gnpda1O88958 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gnpda1O88958 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gnpda1O88958 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gnpda1O88958 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gnpda1O88958 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gnpda1O88958 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gnpda1O88958 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gnpda1O88958 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gnpda1O88958 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gnpda1O88958 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gnpda1O88958 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gnpda1O88958 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gnpda1O88958 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gnpda1O88958 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gnpda1O88958 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Gnpda1O88958 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gnpda1O88958 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gnpda1O88958 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gnpda1O88958 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gnpda1O88958 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gnpda1O88958 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Gnpda1O88958 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gnpda1O88958 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gnpda1O88958 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Gnpda1O88958 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gnpda1O88958 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gnpda1O88958 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gnpda1O88958 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gnpda1O88958 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gnpda1O88958 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gnpda1O88958 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Gnpda1O88958 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gnpda1O88958 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Gnpda1O88958 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gnpda1O88958 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Gnpda1O88958 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gnpda1O88958 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gnpda1O88958 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gnpda1O88958 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gnpda1O88958 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Gnpda1O88958 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Gnpda1O88958 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Gnpda1O88958 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gnpda1O88958 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gnpda1O88958 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Gnpda1O88958 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Gnpda1O88958 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gnpda1O88958 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Gnpda1O88958 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Gnpda1O88958 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gnpda1O88958 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Gnpda1O88958 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms