Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
IkbkbO88351 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
IkbkbO88351 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
IkbkbO88351 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28,84■■■□□ 2,21
IkbkbO88351 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
IkbkbO88351 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
IkbkbO88351 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
IkbkbO88351 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
IkbkbO88351 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
IkbkbO88351 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
IkbkbO88351 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
IkbkbO88351 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
IkbkbO88351 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
IkbkbO88351 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,74■■■□□ 2,19
IkbkbO88351 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
IkbkbO88351 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
IkbkbO88351 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28,7■■■□□ 2,19
IkbkbO88351 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,69■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,69■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28,68■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,67■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,65■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,18
IkbkbO88351 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28,64■■■□□ 2,17
IkbkbO88351 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
IkbkbO88351 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,6■■■□□ 2,17
IkbkbO88351 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
IkbkbO88351 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
IkbkbO88351 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,56■■■□□ 2,16
IkbkbO88351 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC28,55■■■□□ 2,16
IkbkbO88351 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
IkbkbO88351 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
IkbkbO88351 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28,51■■■□□ 2,15
IkbkbO88351 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,5■■■□□ 2,15
IkbkbO88351 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,48■■■□□ 2,15
IkbkbO88351 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,43■■■□□ 2,14
IkbkbO88351 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
IkbkbO88351 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28,43■■■□□ 2,14
IkbkbO88351 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
IkbkbO88351 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
IkbkbO88351 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,4■■■□□ 2,14
IkbkbO88351 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28,4■■■□□ 2,14
IkbkbO88351 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,4■■■□□ 2,14
IkbkbO88351 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
IkbkbO88351 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28,38■■■□□ 2,13
IkbkbO88351 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,36■■■□□ 2,13
IkbkbO88351 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28,36■■■□□ 2,13
IkbkbO88351 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
IkbkbO88351 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
IkbkbO88351 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
IkbkbO88351 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,35■■■□□ 2,13
IkbkbO88351 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28,33■■■□□ 2,13
IkbkbO88351 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
IkbkbO88351 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,32■■■□□ 2,12
IkbkbO88351 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,31■■■□□ 2,12
IkbkbO88351 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,3■■■□□ 2,12
IkbkbO88351 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
IkbkbO88351 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28,29■■■□□ 2,12
IkbkbO88351 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,29■■■□□ 2,12
IkbkbO88351 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,28■■■□□ 2,12
IkbkbO88351 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,28■■■□□ 2,12
IkbkbO88351 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
IkbkbO88351 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,25■■■□□ 2,11
IkbkbO88351 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28,24■■■□□ 2,11
IkbkbO88351 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
IkbkbO88351 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
IkbkbO88351 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28,23■■■□□ 2,11
IkbkbO88351 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,22■■■□□ 2,11
IkbkbO88351 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28,22■■■□□ 2,11
IkbkbO88351 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
IkbkbO88351 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
IkbkbO88351 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
IkbkbO88351 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,18■■■□□ 2,1
IkbkbO88351 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,16■■■□□ 2,1
IkbkbO88351 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
IkbkbO88351 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28,13■■■□□ 2,09
IkbkbO88351 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,11■■■□□ 2,09
IkbkbO88351 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
IkbkbO88351 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,11■■■□□ 2,09
IkbkbO88351 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
IkbkbO88351 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28,09■■■□□ 2,09
IkbkbO88351 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
IkbkbO88351 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,08■■■□□ 2,09
IkbkbO88351 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28,06■■■□□ 2,08
IkbkbO88351 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,06■■■□□ 2,08
IkbkbO88351 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28,04■■■□□ 2,08
IkbkbO88351 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
IkbkbO88351 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28,04■■■□□ 2,08
IkbkbO88351 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
IkbkbO88351 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
IkbkbO88351 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
IkbkbO88351 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
IkbkbO88351 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28,01■■■□□ 2,07
IkbkbO88351 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,01■■■□□ 2,07
IkbkbO88351 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2,07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms