Protein–RNA interactions for Protein: O70496

Clcn7, H(+)/Cl(-) exchange transporter 7, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn7O70496 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Clcn7O70496 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn7O70496 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn7O70496 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Clcn7O70496 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Clcn7O70496 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn7O70496 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn7O70496 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Clcn7O70496 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Clcn7O70496 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn7O70496 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Clcn7O70496 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn7O70496 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Clcn7O70496 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn7O70496 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Clcn7O70496 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Clcn7O70496 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Clcn7O70496 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Clcn7O70496 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn7O70496 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Clcn7O70496 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Clcn7O70496 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Clcn7O70496 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Clcn7O70496 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn7O70496 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Clcn7O70496 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Clcn7O70496 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn7O70496 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn7O70496 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Clcn7O70496 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Clcn7O70496 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Clcn7O70496 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Clcn7O70496 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn7O70496 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn7O70496 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Clcn7O70496 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Clcn7O70496 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn7O70496 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Clcn7O70496 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Clcn7O70496 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn7O70496 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn7O70496 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Clcn7O70496 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Clcn7O70496 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Clcn7O70496 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Clcn7O70496 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Clcn7O70496 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn7O70496 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clcn7O70496 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn7O70496 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clcn7O70496 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn7O70496 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn7O70496 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clcn7O70496 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clcn7O70496 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Clcn7O70496 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn7O70496 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn7O70496 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clcn7O70496 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clcn7O70496 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Clcn7O70496 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn7O70496 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn7O70496 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clcn7O70496 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clcn7O70496 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clcn7O70496 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms