Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Lnx1O70263 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.57■■■□□ 2.49
Lnx1O70263 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Lnx1O70263 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Lnx1O70263 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Lnx1O70263 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Lnx1O70263 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Lnx1O70263 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Lnx1O70263 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Lnx1O70263 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Lnx1O70263 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Lnx1O70263 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Lnx1O70263 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.01■■■□□ 2.4
Lnx1O70263 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Lnx1O70263 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Lnx1O70263 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Lnx1O70263 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Lnx1O70263 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Lnx1O70263 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Lnx1O70263 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Lnx1O70263 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Lnx1O70263 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Lnx1O70263 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Lnx1O70263 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Lnx1O70263 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
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