Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Top3aO70157 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Top3aO70157 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Top3aO70157 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Top3aO70157 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Top3aO70157 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top3aO70157 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Top3aO70157 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Top3aO70157 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Top3aO70157 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Top3aO70157 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Top3aO70157 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top3aO70157 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top3aO70157 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top3aO70157 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top3aO70157 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top3aO70157 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Top3aO70157 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Top3aO70157 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Top3aO70157 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Top3aO70157 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Top3aO70157 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top3aO70157 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top3aO70157 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Top3aO70157 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Top3aO70157 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top3aO70157 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Top3aO70157 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Top3aO70157 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Top3aO70157 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Top3aO70157 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top3aO70157 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top3aO70157 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Top3aO70157 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Top3aO70157 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top3aO70157 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top3aO70157 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Top3aO70157 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Top3aO70157 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Top3aO70157 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top3aO70157 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Top3aO70157 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top3aO70157 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Top3aO70157 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Top3aO70157 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Top3aO70157 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Top3aO70157 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Top3aO70157 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top3aO70157 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Top3aO70157 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Top3aO70157 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top3aO70157 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Top3aO70157 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Top3aO70157 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Top3aO70157 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top3aO70157 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Top3aO70157 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Top3aO70157 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Top3aO70157 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Top3aO70157 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top3aO70157 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top3aO70157 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top3aO70157 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Top3aO70157 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top3aO70157 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top3aO70157 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top3aO70157 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Top3aO70157 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Top3aO70157 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 439.2 ms