Protein–RNA interactions for Protein: O55134

Pcdh12, Protocadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 1,180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdh12O55134 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pcdh12O55134 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh12O55134 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh12O55134 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pcdh12O55134 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pcdh12O55134 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh12O55134 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pcdh12O55134 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Pcdh12O55134 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh12O55134 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pcdh12O55134 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pcdh12O55134 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh12O55134 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pcdh12O55134 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Pcdh12O55134 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Pcdh12O55134 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh12O55134 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Pcdh12O55134 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdh12O55134 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pcdh12O55134 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pcdh12O55134 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Pcdh12O55134 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdh12O55134 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pcdh12O55134 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pcdh12O55134 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdh12O55134 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pcdh12O55134 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pcdh12O55134 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pcdh12O55134 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh12O55134 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Pcdh12O55134 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Pcdh12O55134 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdh12O55134 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdh12O55134 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdh12O55134 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh12O55134 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh12O55134 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh12O55134 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdh12O55134 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdh12O55134 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdh12O55134 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh12O55134 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh12O55134 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdh12O55134 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdh12O55134 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdh12O55134 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh12O55134 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcdh12O55134 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh12O55134 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcdh12O55134 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh12O55134 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcdh12O55134 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcdh12O55134 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pcdh12O55134 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh12O55134 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pcdh12O55134 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pcdh12O55134 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh12O55134 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pcdh12O55134 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pcdh12O55134 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh12O55134 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pcdh12O55134 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pcdh12O55134 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms