Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20,73■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20,72■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20,72■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,71■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,7■□□□□ 0,91
Syngr2O55101 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Syngr2O55101 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Syngr2O55101 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,7■□□□□ 0,9
Syngr2O55101 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,69■□□□□ 0,9
Syngr2O55101 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,69■□□□□ 0,9
Syngr2O55101 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,68■□□□□ 0,9
Syngr2O55101 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,66■□□□□ 0,9
Syngr2O55101 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,66■□□□□ 0,9
Syngr2O55101 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,65■□□□□ 0,9
Syngr2O55101 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,64■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20,64■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,63■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20,63■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20,63■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,62■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,61■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,6■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20,59■□□□□ 0,89
Syngr2O55101 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20,57■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Syngr2O55101 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Syngr2O55101 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20,51■□□□□ 0,87
Syngr2O55101 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Syngr2O55101 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Syngr2O55101 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Syngr2O55101 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Syngr2O55101 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Syngr2O55101 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Syngr2O55101 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Syngr2O55101 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,45■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20,43■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,43■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20,41■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Syngr2O55101 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Syngr2O55101 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Syngr2O55101 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,38■□□□□ 0,85
Syngr2O55101 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20,37■□□□□ 0,85
Syngr2O55101 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC20,35■□□□□ 0,85
Syngr2O55101 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,35■□□□□ 0,85
Syngr2O55101 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,34■□□□□ 0,85
Syngr2O55101 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20,33■□□□□ 0,85
Syngr2O55101 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,32■□□□□ 0,84
Syngr2O55101 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,3■□□□□ 0,84
Syngr2O55101 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20,3■□□□□ 0,84
Syngr2O55101 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,28■□□□□ 0,84
Syngr2O55101 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,26■□□□□ 0,83
Syngr2O55101 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20,24■□□□□ 0,83
Syngr2O55101 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20,24■□□□□ 0,83
Syngr2O55101 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Syngr2O55101 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Syngr2O55101 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
Syngr2O55101 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Syngr2O55101 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Syngr2O55101 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
Syngr2O55101 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20,2■□□□□ 0,82
Syngr2O55101 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Syngr2O55101 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,19■□□□□ 0,82
Syngr2O55101 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
Syngr2O55101 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,6 ms