Protein–RNA interactions for Protein: O54799

Nmbr, Neuromedin-B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NmbrO54799 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NmbrO54799 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NmbrO54799 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NmbrO54799 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NmbrO54799 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NmbrO54799 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NmbrO54799 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NmbrO54799 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NmbrO54799 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NmbrO54799 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NmbrO54799 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
NmbrO54799 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NmbrO54799 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NmbrO54799 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NmbrO54799 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NmbrO54799 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NmbrO54799 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NmbrO54799 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NmbrO54799 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NmbrO54799 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NmbrO54799 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NmbrO54799 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NmbrO54799 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NmbrO54799 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NmbrO54799 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NmbrO54799 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NmbrO54799 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NmbrO54799 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmbrO54799 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmbrO54799 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmbrO54799 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NmbrO54799 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NmbrO54799 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NmbrO54799 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NmbrO54799 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NmbrO54799 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
NmbrO54799 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NmbrO54799 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NmbrO54799 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NmbrO54799 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NmbrO54799 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NmbrO54799 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NmbrO54799 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NmbrO54799 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NmbrO54799 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NmbrO54799 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NmbrO54799 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NmbrO54799 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
NmbrO54799 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NmbrO54799 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
NmbrO54799 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NmbrO54799 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NmbrO54799 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NmbrO54799 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
NmbrO54799 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NmbrO54799 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NmbrO54799 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NmbrO54799 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NmbrO54799 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NmbrO54799 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NmbrO54799 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms