Protein–RNA interactions for Protein: O35125

Lrrc23, Leucine-rich repeat-containing protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc23O35125 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrrc23O35125 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc23O35125 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrrc23O35125 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrrc23O35125 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrrc23O35125 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lrrc23O35125 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc23O35125 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrrc23O35125 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrrc23O35125 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc23O35125 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrrc23O35125 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrrc23O35125 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc23O35125 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc23O35125 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrrc23O35125 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrrc23O35125 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrrc23O35125 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrrc23O35125 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrrc23O35125 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Lrrc23O35125 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc23O35125 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc23O35125 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrrc23O35125 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lrrc23O35125 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrrc23O35125 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrrc23O35125 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrrc23O35125 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc23O35125 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrrc23O35125 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrrc23O35125 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrrc23O35125 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc23O35125 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrrc23O35125 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrrc23O35125 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc23O35125 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc23O35125 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lrrc23O35125 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrrc23O35125 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lrrc23O35125 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc23O35125 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lrrc23O35125 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrrc23O35125 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc23O35125 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc23O35125 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrrc23O35125 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lrrc23O35125 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc23O35125 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Lrrc23O35125 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc23O35125 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lrrc23O35125 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lrrc23O35125 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc23O35125 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lrrc23O35125 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lrrc23O35125 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc23O35125 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lrrc23O35125 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lrrc23O35125 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lrrc23O35125 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lrrc23O35125 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lrrc23O35125 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms