Protein–RNA interactions for Protein: O19441

H2-Q1, Histocompatibility 2, Q region locus 1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q1O19441 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2-Q1O19441 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2-Q1O19441 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
H2-Q1O19441 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2-Q1O19441 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
H2-Q1O19441 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2-Q1O19441 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
H2-Q1O19441 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
H2-Q1O19441 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
H2-Q1O19441 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
H2-Q1O19441 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
H2-Q1O19441 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2-Q1O19441 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
H2-Q1O19441 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
H2-Q1O19441 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q1O19441 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
H2-Q1O19441 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2-Q1O19441 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
H2-Q1O19441 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
H2-Q1O19441 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
H2-Q1O19441 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
H2-Q1O19441 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
H2-Q1O19441 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
H2-Q1O19441 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q1O19441 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
H2-Q1O19441 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
H2-Q1O19441 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
H2-Q1O19441 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-Q1O19441 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
H2-Q1O19441 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
H2-Q1O19441 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
H2-Q1O19441 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
H2-Q1O19441 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q1O19441 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q1O19441 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
H2-Q1O19441 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q1O19441 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
H2-Q1O19441 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q1O19441 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
H2-Q1O19441 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
H2-Q1O19441 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H2-Q1O19441 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q1O19441 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q1O19441 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q1O19441 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
H2-Q1O19441 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Q1O19441 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H2-Q1O19441 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
H2-Q1O19441 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
H2-Q1O19441 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q1O19441 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q1O19441 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
H2-Q1O19441 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H2-Q1O19441 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H2-Q1O19441 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
H2-Q1O19441 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
H2-Q1O19441 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
H2-Q1O19441 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H2-Q1O19441 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-Q1O19441 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-Q1O19441 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H2-Q1O19441 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
H2-Q1O19441 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms