Protein–RNA interactions for Protein: O09173

Hgd, Homogentisate 1,2-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HgdO09173 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HgdO09173 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
HgdO09173 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HgdO09173 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HgdO09173 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HgdO09173 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HgdO09173 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HgdO09173 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HgdO09173 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HgdO09173 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HgdO09173 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HgdO09173 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HgdO09173 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HgdO09173 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HgdO09173 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HgdO09173 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HgdO09173 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HgdO09173 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HgdO09173 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HgdO09173 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HgdO09173 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HgdO09173 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HgdO09173 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HgdO09173 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HgdO09173 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HgdO09173 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HgdO09173 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HgdO09173 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HgdO09173 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HgdO09173 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HgdO09173 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HgdO09173 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HgdO09173 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HgdO09173 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HgdO09173 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HgdO09173 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HgdO09173 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HgdO09173 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HgdO09173 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HgdO09173 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HgdO09173 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HgdO09173 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HgdO09173 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HgdO09173 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HgdO09173 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HgdO09173 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HgdO09173 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HgdO09173 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HgdO09173 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HgdO09173 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HgdO09173 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HgdO09173 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HgdO09173 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HgdO09173 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HgdO09173 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HgdO09173 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HgdO09173 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HgdO09173 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HgdO09173 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HgdO09173 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HgdO09173 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HgdO09173 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HgdO09173 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HgdO09173 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HgdO09173 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HgdO09173 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HgdO09173 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HgdO09173 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HgdO09173 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HgdO09173 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HgdO09173 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HgdO09173 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HgdO09173 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HgdO09173 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HgdO09173 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HgdO09173 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HgdO09173 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HgdO09173 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HgdO09173 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HgdO09173 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HgdO09173 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
HgdO09173 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HgdO09173 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HgdO09173 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HgdO09173 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HgdO09173 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HgdO09173 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HgdO09173 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HgdO09173 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HgdO09173 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HgdO09173 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HgdO09173 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HgdO09173 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HgdO09173 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HgdO09173 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HgdO09173 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HgdO09173 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HgdO09173 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HgdO09173 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HgdO09173 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms