Protein–RNA interactions for Protein: J3QNY8

Gm19965, Predicted gene, 19965, mousemouse

Predictions only

Length 723 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm19965J3QNY8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gm19965J3QNY8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gm19965J3QNY8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm19965J3QNY8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gm19965J3QNY8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm19965J3QNY8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm19965J3QNY8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Gm19965J3QNY8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gm19965J3QNY8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Gm19965J3QNY8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gm19965J3QNY8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gm19965J3QNY8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm19965J3QNY8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gm19965J3QNY8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gm19965J3QNY8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm19965J3QNY8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm19965J3QNY8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gm19965J3QNY8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm19965J3QNY8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gm19965J3QNY8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gm19965J3QNY8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gm19965J3QNY8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gm19965J3QNY8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gm19965J3QNY8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Gm19965J3QNY8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm19965J3QNY8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm19965J3QNY8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Gm19965J3QNY8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Gm19965J3QNY8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gm19965J3QNY8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gm19965J3QNY8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gm19965J3QNY8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gm19965J3QNY8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm19965J3QNY8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Gm19965J3QNY8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm19965J3QNY8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gm19965J3QNY8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gm19965J3QNY8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gm19965J3QNY8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm19965J3QNY8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gm19965J3QNY8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm19965J3QNY8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gm19965J3QNY8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm19965J3QNY8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gm19965J3QNY8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm19965J3QNY8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gm19965J3QNY8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gm19965J3QNY8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm19965J3QNY8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gm19965J3QNY8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gm19965J3QNY8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm19965J3QNY8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gm19965J3QNY8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Gm19965J3QNY8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gm19965J3QNY8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gm19965J3QNY8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm19965J3QNY8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gm19965J3QNY8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gm19965J3QNY8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gm19965J3QNY8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gm19965J3QNY8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gm19965J3QNY8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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