Protein–RNA interactions for Protein: J3QM38

Zfp994, Zinc finger protein 994, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp994J3QM38 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zfp994J3QM38 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp994J3QM38 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zfp994J3QM38 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp994J3QM38 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp994J3QM38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Zfp994J3QM38 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp994J3QM38 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zfp994J3QM38 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp994J3QM38 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp994J3QM38 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zfp994J3QM38 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp994J3QM38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp994J3QM38 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zfp994J3QM38 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zfp994J3QM38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zfp994J3QM38 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Zfp994J3QM38 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Zfp994J3QM38 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Zfp994J3QM38 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp994J3QM38 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Zfp994J3QM38 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp994J3QM38 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp994J3QM38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp994J3QM38 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Zfp994J3QM38 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Zfp994J3QM38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp994J3QM38 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp994J3QM38 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp994J3QM38 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp994J3QM38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp994J3QM38 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp994J3QM38 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp994J3QM38 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp994J3QM38 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp994J3QM38 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp994J3QM38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp994J3QM38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp994J3QM38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp994J3QM38 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp994J3QM38 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp994J3QM38 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp994J3QM38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp994J3QM38 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp994J3QM38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Zfp994J3QM38 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp994J3QM38 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Zfp994J3QM38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Zfp994J3QM38 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp994J3QM38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Zfp994J3QM38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Zfp994J3QM38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Zfp994J3QM38 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Zfp994J3QM38 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Zfp994J3QM38 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Zfp994J3QM38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp994J3QM38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Zfp994J3QM38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Zfp994J3QM38 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Zfp994J3QM38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms