Protein–RNA interactions for Protein: G5E829

Atp2b1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b1G5E829 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Atp2b1G5E829 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Atp2b1G5E829 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Atp2b1G5E829 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29,84■■■□□ 2,37
Atp2b1G5E829 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Atp2b1G5E829 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Atp2b1G5E829 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Atp2b1G5E829 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Atp2b1G5E829 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29,82■■■□□ 2,36
Atp2b1G5E829 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Atp2b1G5E829 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Atp2b1G5E829 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Atp2b1G5E829 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,7■■■□□ 2,34
Atp2b1G5E829 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Atp2b1G5E829 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Atp2b1G5E829 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29,68■■■□□ 2,34
Atp2b1G5E829 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Atp2b1G5E829 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Atp2b1G5E829 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29,62■■■□□ 2,33
Atp2b1G5E829 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,61■■■□□ 2,33
Atp2b1G5E829 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Atp2b1G5E829 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Atp2b1G5E829 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Atp2b1G5E829 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,57■■■□□ 2,32
Atp2b1G5E829 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Atp2b1G5E829 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Atp2b1G5E829 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Atp2b1G5E829 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Atp2b1G5E829 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Atp2b1G5E829 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Atp2b1G5E829 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Atp2b1G5E829 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29,41■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29,4■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC29,39■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC29,39■■■□□ 2,3
Atp2b1G5E829 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Atp2b1G5E829 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Atp2b1G5E829 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Atp2b1G5E829 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,34■■■□□ 2,29
Atp2b1G5E829 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,32■■■□□ 2,28
Atp2b1G5E829 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Atp2b1G5E829 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,32■■■□□ 2,28
Atp2b1G5E829 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Atp2b1G5E829 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Atp2b1G5E829 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,28■■■□□ 2,28
Atp2b1G5E829 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Atp2b1G5E829 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,28■■■□□ 2,28
Atp2b1G5E829 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,27■■■□□ 2,28
Atp2b1G5E829 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29,24■■■□□ 2,27
Atp2b1G5E829 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Atp2b1G5E829 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,24■■■□□ 2,27
Atp2b1G5E829 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,22■■■□□ 2,27
Atp2b1G5E829 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,22■■■□□ 2,27
Atp2b1G5E829 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,21■■■□□ 2,27
Atp2b1G5E829 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29,18■■■□□ 2,26
Atp2b1G5E829 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Atp2b1G5E829 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Atp2b1G5E829 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC29,17■■■□□ 2,26
Atp2b1G5E829 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Atp2b1G5E829 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,16■■■□□ 2,26
Atp2b1G5E829 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29,15■■■□□ 2,26
Atp2b1G5E829 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,26
Atp2b1G5E829 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Atp2b1G5E829 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Atp2b1G5E829 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,11■■■□□ 2,25
Atp2b1G5E829 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,1■■■□□ 2,25
Atp2b1G5E829 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,09■■■□□ 2,25
Atp2b1G5E829 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,09■■■□□ 2,25
Atp2b1G5E829 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Atp2b1G5E829 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
Atp2b1G5E829 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Atp2b1G5E829 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Atp2b1G5E829 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
Atp2b1G5E829 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,02■■■□□ 2,24
Atp2b1G5E829 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Atp2b1G5E829 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,99■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28,99■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,23
Atp2b1G5E829 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
Atp2b1G5E829 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Atp2b1G5E829 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,94■■■□□ 2,22
Atp2b1G5E829 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
Atp2b1G5E829 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28,94■■■□□ 2,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23,5 ms