Protein–RNA interactions for Protein: G3XA45

Vmn2r69, MCG59833, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r69G3XA45 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vmn2r69G3XA45 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vmn2r69G3XA45 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn2r69G3XA45 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vmn2r69G3XA45 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn2r69G3XA45 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vmn2r69G3XA45 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn2r69G3XA45 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vmn2r69G3XA45 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r69G3XA45 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vmn2r69G3XA45 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vmn2r69G3XA45 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vmn2r69G3XA45 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Vmn2r69G3XA45 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vmn2r69G3XA45 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r69G3XA45 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r69G3XA45 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Vmn2r69G3XA45 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vmn2r69G3XA45 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vmn2r69G3XA45 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vmn2r69G3XA45 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Vmn2r69G3XA45 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn2r69G3XA45 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn2r69G3XA45 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Vmn2r69G3XA45 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r69G3XA45 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r69G3XA45 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Vmn2r69G3XA45 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn2r69G3XA45 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Vmn2r69G3XA45 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn2r69G3XA45 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r69G3XA45 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn2r69G3XA45 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn2r69G3XA45 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn2r69G3XA45 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r69G3XA45 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn2r69G3XA45 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r69G3XA45 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn2r69G3XA45 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r69G3XA45 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r69G3XA45 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r69G3XA45 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn2r69G3XA45 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn2r69G3XA45 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn2r69G3XA45 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn2r69G3XA45 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn2r69G3XA45 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r69G3XA45 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn2r69G3XA45 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn2r69G3XA45 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r69G3XA45 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn2r69G3XA45 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn2r69G3XA45 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn2r69G3XA45 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn2r69G3XA45 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r69G3XA45 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r69G3XA45 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn2r69G3XA45 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vmn2r69G3XA45 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r69G3XA45 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vmn2r69G3XA45 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn2r69G3XA45 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn2r69G3XA45 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn2r69G3XA45 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn2r69G3XA45 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r69G3XA45 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r69G3XA45 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn2r69G3XA45 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn2r69G3XA45 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r69G3XA45 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn2r69G3XA45 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn2r69G3XA45 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn2r69G3XA45 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r69G3XA45 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn2r69G3XA45 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r69G3XA45 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vmn2r69G3XA45 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms